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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G000048`

染色体: Chr03 坐标: 502835-504501 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G000048`
名称	SmilChr03G000048
描述	uncharacterized SmilChr03G000048
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	502835 - 504501 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131016929`
GeneID	`131016929`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131016929`
原始查询	`SmilChr03G000048`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	transmembrane protein, putative (DUF2358) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842830]; symbol=AT1G65230; hit=AT1G65230; species=arabidopsis; confidence=high
产物	transmembrane protein, putative (DUF2358) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842830]; symbol=AT1G65230; hit=AT1G65230; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT1G65230` (AT1G65230) transmembrane protein, putative (DUF2358) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842830] identity=66.3; qcov=0.835; evalue=6.95e-125; confidence=high
Rice	`Os01g0912700` - identity=62.7; qcov=0.877; evalue=1.51e-118; confidence=high
GO	GO:0009507 (chloroplast)
KEGG	-
Pfam	PF10184 (DUF2358)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131016929

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057801717.1`
2	Chloroplast membrane	叶绿体膜	1.00000	`XP_057801717.1`
3	Chloroplast thylakoid	类囊体	1.00000	`XP_057801717.1`
4	Chloroplast thylakoid membrane	类囊体膜	0.20000	`XP_057801717.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057801717.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:503195`	`TA`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	11	B128,B139,B25,B63,B83,B95,B98,C1,C59,C9,D8
`Chr3:503205`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B67,B91
`Chr3:503237`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B46
`Chr3:503282`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B75
`Chr3:503415`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B21,C63,C67
`Chr3:503463`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B48,C40
`Chr3:503470`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B44
`Chr3:503478`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C28
`Chr3:503529`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B115,B91,B93,C33
`Chr3:503576`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C63,C67
`Chr3:503714`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C82
`Chr3:503733`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B131,C63,C67

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057801717.1

309 aa

154

309

DUF2358

PF10184 DUF2358 119-213 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057801717.1`	Pfam	`PF10184`	DUF2358	Domain	119	213	9.7e-08	33.0	Uncharacterized conserved protein (DUF2358)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057945734.1
CTCTCTCTAGATATAATACCAAACAAGATACAAAGTTATAATATGACATTAACCGAATTAATTCCTTGAAATAGATGATATTTACAACAGAATGAGTGCACCAAGTGGGGTAACGTGGCCACTAAAAGCATATATGGCACAGATTATTACATGATGCATTCAGACCACATAGCTTCTTACACACCTTATCCAAACACACCTAGATTTTGTGGGAGAAACAAAACCAAAGGTGACACACCATCACAAAATCAATAATCCAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131016929
ATGACCACTTGTGTCACAATTCTCCCTCCTAATTCCTCCTCCTCCTCCTCTCCTTCCGTCAACTTAAAAAACTCGTCGTTTCCATGCCGTGCGCTGACCTACATCAGAAATGCCACCATCTCCAAGCATGGCCTGAATAAGCCTTCGTTTCGTCGTCTCCACCATACCGATGTTTCCCTTCGAGTTGCAAATGAGAGGGCAGAAGTATCTCCTGATCAAAAATCAGAGGCTGACAAGATCGTAGACGGCATGGACTTTGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057801717.1
MTTCVTILPPNSSSSSSPSVNLKNSSFPCRALTYIRNATISKHGLNKPSFRRLHHTDVSLRVANERAEVSPDQKSEADKIVDGMDFGELCNEFECISSPLVESTARQLVRDILELRQGNRALGSYAVSVKYKDPVRSFTGRDKYKRRLWATDALQNPTVSVQQMVMLSTSLLNIKWTLRGKPKSPIFAIGGDLTLKVDSKFTLNQISGQVVEHQESWDTSQSSPIAQAYFWASRRLFATIETGKDVSDSIKDVSKRFPKE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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