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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G000054`

染色体: Chr03 坐标: 526416-527238 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G000054`
名称	SmilChr03G000054
描述	protein TIC 20-II, chloroplastic-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	526416 - 527238 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131016954`
GeneID	`131016954`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131016954`
原始查询	`SmilChr03G000054`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein TIC 20-II, chloroplastic-like
产物	protein TIC 20-II%2C chloroplastic-like
Arabidopsis	`AT2G47840` (Tic20-II) putative conserved protein ycf60 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819396] identity=62.9; qcov=0.966; evalue=5.8e-78; confidence=high
Rice	`Os02g0726600` - identity=48.1; qcov=0.662; evalue=1.42e-28; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF16166 (TIC20)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131016954

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057801779.1`
2	Chloroplast membrane	叶绿体膜	1.00000	`XP_057801779.1`
3	Chloroplast thylakoid membrane	类囊体膜	0.40000	`XP_057801779.1`
4	Chloroplast thylakoid	类囊体	0.20000	`XP_057801779.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057801779.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:526530`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B74,C14,C19,C71
`Chr3:526614`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B118,B74,C14,C19,C71
`Chr3:526654`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	C1,C11,C18,C69
`Chr3:526774`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B46,B66,B67,B91,C8
`Chr3:526777`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B137
`Chr3:526812`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	B117,B128
`Chr3:526812`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	2	B117,B128
`Chr3:526819`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B133
`Chr3:526837`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B110,B78,C17,C21,C55
`Chr3:526945`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B21,C35
`Chr3:526963`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B123
`Chr3:527062`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B82

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057801779.1

204 aa

102

204

TIC20

PF16166 TIC20 56-199 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057801779.1`	Pfam	`PF16166`	TIC20	Family	56	199	2.9e-42	145.2	Chloroplast import apparatus Tic20-like

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057945796.1
TGCAATAAACTCTATTTAAAATTCGATATGTAATTCTTCTTCCCCTTGGCTTTACTTATAATTTGCAGACATTCAATTGAAAATCCCTATTCCAAAAACCCTAAAAACCCAATCATGGCTTCCATTCCCCTCCTCCGCCTCTCCCTCCCCAATCGCCCCGCCGTCCGCCTCCCCCACCCCCTCAAATCCACCCTTCACCCACCTCCCCAAATCCGCCCCAAATCAATCACCACGACGACCACATCGAGGTGCTCCTACAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131016954
ATGGCTTCCATTCCCCTCCTCCGCCTCTCCCTCCCCAATCGCCCCGCCGTCCGCCTCCCCCACCCCCTCAAATCCACCCTTCACCCACCTCCCCAAATCCGCCCCAAATCAATCACCACGACGACCACATCGAGGTGCTCCTACACTCCAACGCCGGCGACGGACCGCCTGATCTCCGCCGCTTCCTACTTCATCCCCTTCTTCAACGGCCTCCAGTACGGCCGGTTTCTGTTCGCGAAGTACCCTCTCCTCGCCGCCCC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057801779.1
MASIPLLRLSLPNRPAVRLPHPLKSTLHPPPQIRPKSITTTTTSRCSYTPTPATDRLISAASYFIPFFNGLQYGRFLFAKYPLLAAPFEPLIPLLSLYHSVPYASFVTFFGLYLGVVRNPSFSRYARFNALQALVLDVLLVLPVLLQRIIAPGRSGIGLKVTAWAYSGLFLFVVACFVYGLVSSVLGKTPYLPIVAQAAGRQLE

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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