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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G000062`

染色体: Chr03 坐标: 691681-699798 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G000062`
名称	SmilChr03G000062
描述	putative late blight resistance protein homolog R1B-16
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	691681 - 699798 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131016831`
GeneID	`131016831`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131016831`
原始查询	`SmilChr03G000062`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative late blight resistance protein homolog R1B-16
产物	putative late blight resistance protein homolog R1B-16
Arabidopsis	`AT1G53350` (AT1G53350) Disease resistance protein (CC-NBS-LRR class) family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841771] identity=28; qcov=1.01; evalue=3.15e-65; confidence=low
Rice	`Os07g0186500` - identity=30.6; qcov=0.814; evalue=2.43e-77; confidence=low
GO	GO:0043531 (ADP binding); GO:0098542 (defense response to other organism)
KEGG	-
Pfam	PF00931 (NB-ARC); PF23559 (WHD_DRP); PF23598 (LRR_14)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131016831

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	0.80000	`XP_057801579.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057801579.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057801579.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057801579.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057801579.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:692043`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B117,B137,B25,C46
`Chr3:692244`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B44,C65
`Chr3:692267`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A16,B138,C29,D5
`Chr3:692275`	`G`	`GA`	1bp_insertion	frameshift_variant	124	A1,A13,A18,A19,A20,A22,A23,A25,A4,B102,B103,B106,B111,B112,B113,B114,B117,B118,B119,B12,B120,B122,B125,B127,B128,B13,B130,B131,B133,B134,B136,B137,B138,B14,B140,B19,B20,B29,B3,B30,B32,B34,B37,B38,B39,B4,B44,B45,B47,B49,B51,B52,B53,B54,B56,B59,B6,B61,B66,B7,B70,B75,B76,B77,B79,B84,B85,B86,B88,B9,B94,B95,B96,B98,C1,C10,C11,C12,C13,C14,C17,C19,C21,C22,C23,C24,C26,C27,C28,C3,C30,C33,C34,C35,C36,C37,C43,C45,C47,C48,C5,C50,C51,C52,C53,C55,C56,C61,C62,C64,C67,C69,C75,C76,C77,C78,C80,C82,C83,C85,C86,C9,D1,D6
`Chr3:692282`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	82	A13,A18,A19,A20,A23,A25,A4,B103,B106,B111,B112,B113,B117,B118,B119,B120,B125,B127,B128,B133,B136,B137,B140,B29,B3,B30,B32,B37,B4,B44,B45,B47,B51,B52,B53,B56,B59,B6,B61,B66,B7,B75,B79,B84,B85,B86,B88,B95,B96,B98,C11,C12,C14,C17,C19,C21,C23,C24,C28,C30,C33,C35,C36,C37,C47,C5,C51,C52,C53,C56,C61,C62,C67,C69,C77,C78,C80,C83,C85,C86,C9,D1
`Chr3:692285`	`T`	`TA`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	C64
`Chr3:692285`	`T`	`TA`	1bp_insertion	CDS_variant	1	C64
`Chr3:692292`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B31,C33
`Chr3:692346`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B139,C1,C9,D8
`Chr3:692349`	`C`	`CG`	1bp_insertion	frameshift_variant	2	B102,C16
`Chr3:692349`	`C`	`CG`	1bp_insertion	CDS_variant	2	B102,C16
`Chr3:692355`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B118,C61

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057801579.1

854 aa

427

854

NB-ARC

WHD_DRP

LRR_14

PF00931 NB-ARC 136-298 aa PF23559 WHD_DRP 383-453 aa PF23598 LRR_14 514-698 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057801579.1`	Pfam	`PF00931`	NB-ARC	Domain	136	298	1.3e-38	133.0	NB-ARC domain
`XP_057801579.1`	Pfam	`PF23559`	WHD_DRP	Domain	383	453	1.4e-18	67.4	Disease resistance protein Winged helix domain
`XP_057801579.1`	Pfam	`PF23598`	LRR_14	Repeat	514	698	3.4e-19	69.5	Leucine-rich repeat region

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057945596.1
GGCAATTAATGTGATTGTGAAAGCTAGCCACATATTGTTTATGATAATAATGGAGGAGATATAGCCATTGTTACTTTACACATTGTTTCTTTGTTGAACCTAACTAAGATTCTATCAAATTCTTGACCGAAATTCTCTGCAAAAATATGCACTGCTTTTCCTTCAACTGAGATTGATCATGGCAGCCTATGCAGCCATAGTTTCTCTTATGAATACACATTGTTGTTTGTATCGACAAACAACAAGTTGAATCTCTCACT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131016831
ATGCGTATTGTAGATGCAGCTCATGCCGTTCAAGATGTTATCGAATCATATATTATGAACGTGATTGAACTGGGTAGATCTAGTCCCAATGAAGAATCTCATATTTGTGTCAAGGTTCGGTTGAGCATATCCAAACTAGCCAAAATCTGCTGCTTCTTCAACTGCTTTGGAGATGCAGCTCATGCGGCTGAAGAAGTGAATTCTAGAGAGGAAGTCAGTTGCATCGACTTCTATCAAGATCTACAGCAAGTGATAGAAGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057801579.1
MRIVDAAHAVQDVIESYIMNVIELGRSSPNEESHICVKVRLSISKLAKICCFFNCFGDAAHAAEEVNSREEVSCIDFYQDLQQVIEEMNVIKKEAMETSAEAQMQRKVSSTHAGSLTSSSTVKESMMVGFDDVQLQLLDRLTGGNRNRQIIPITGMGGIGKTTLARHIFEHALVKEHFDIRAWTTISQTYNVRETLSQVLHQVTGNLGSDLSENELGEKLYKYLYGRRYIIILDDMWSVEVWNKMRFFFPDYNDGSRVIV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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