当前解析结果
SmilChr03G000070| 统一新 Gene ID | SmilChr03G000070 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr03G000070 |
| 描述 | splicing factor U2af large subunit B-like |
| 染色体 / SeqID | Chr03 / NC_080389.1 |
| 坐标与链方向 | 828588 - 829559 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131016976 |
|---|---|
| GeneID | 131016976 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131016976 |
| 原始查询 | SmilChr03G000070 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | splicing factor U2af large subunit B-like |
| 产物 | splicing factor U2af large subunit B-like |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131016976 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057801815.1 |
| 2 | Nucleoplasm | 核质 | 0.60000 | XP_057801815.1 |
| 3 | Nuclear speckle | 核斑点 | 0.20000 | XP_057801815.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057801815.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057801815.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr3:828644 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B115 |
Chr3:828753 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 6 | B128,B37,B63,B95,C79,C9 |
Chr3:828783 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 2 | B135,C41 |
Chr3:828783 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B135,C41 |
Chr3:828786 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A20,B62,C20,C73 |
Chr3:828787 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B22 |
Chr3:828805 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A7,B53,B94,C39 |
Chr3:828806 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B114,B18,B48,C27 |
Chr3:828828 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C57 |
Chr3:828854 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B135,B140 |
Chr3:828940 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B104 |
Chr3:828954 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B38,B55,B62 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。