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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G000074`

染色体: Chr03 坐标: 914631-920110 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G000074`
名称	SmilChr03G000074
描述	splicing factor U2AF-associated protein 2-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	914631 - 920110 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131016874`
GeneID	`131016874`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131016874`
原始查询	`SmilChr03G000074`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	splicing factor U2AF-associated protein 2-like
产物	splicing factor U2AF-associated protein 2-like
Arabidopsis	`AT5G16260` (ELF9) RNA binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831486] identity=58.2; qcov=1.08; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os04g0496400` - identity=61.2; qcov=0.992; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0000398 (mRNA splicing, via spliceosome); GO:0003723 (RNA binding); GO:0005684 (U2-type spliceosomal complex); GO:0005686 (U2 snRNP)
KEGG	-
Pfam	PF00076 (RRM_1); PF14237 (GYF_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131016874

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057801639.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057801639.1`
3	Nucleoplasm	核质	0.20000	`XP_057801639.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057801639.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057801639.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:915070`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B38,B39,C14
`Chr3:915491`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B12,C44,C87
`Chr3:915519`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B102
`Chr3:915534`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B117,B78
`Chr3:915672`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B31
`Chr3:915707`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	17	A18,A8,B114,B117,B131,B25,B33,B35,B5,B57,B78,C21,C35,C41,C43,C46,C6
`Chr3:916595`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C8
`Chr3:916725`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C47
`Chr3:917764`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B65,B96,C87,D6
`Chr3:918298`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A16
`Chr3:919104`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B64
`Chr3:919104`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B64

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057801639.1

481 aa

240

481

GYF_2

RRM_1

PF14237 GYF_2 16-64 aa PF00076 RRM_1 240-310 aa PF00076 RRM_1 393-448 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057801639.1`	Pfam	`PF14237`	GYF_2	Domain	16	64	4.3e-13	49.5	GYF domain 2
`XP_057801639.1`	Pfam	`PF00076`	RRM_1	Domain	240	310	2.9e-19	69.4	RNA recognition motif
`XP_057801639.1`	Pfam	`PF00076`	RRM_1	Domain	393	448	2.9e-19	69.4	RNA recognition motif

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057945656.1
TGCAGAGCTAAAACAACGAAAACGAGCTAGAAGAAGAAGAAGCTACCAGAAGAAGCGTTGTCCCATGTCGTCGCAACCGCAAATTCCTGAAATGAGTACTGGAGTTGGATGGTATATTCTTGGTCAGGACCAGCAGCTTATTGGTCCTTACACAATCTCTGAGCTGCAAGAGCATCACTCGAGTGCCTATTTGCATGAAAGTACACTTGTATGGGCTGAAGGGTGCAGTGATTGGCAGCCACTGTCATCAGTTCTTGGCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131016874
ATGTCGTCGCAACCGCAAATTCCTGAAATGAGTACTGGAGTTGGATGGTATATTCTTGGTCAGGACCAGCAGCTTATTGGTCCTTACACAATCTCTGAGCTGCAAGAGCATCACTCGAGTGCCTATTTGCATGAAAGTACACTTGTATGGGCTGAAGGGTGCAGTGATTGGCAGCCACTGTCATCAGTTCTTGGCCTCTCAACTGGTTCTCAGCAGAATGCTCCGACTGCAGTTCCTGCTACCTCTAATGAAGAAGATGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057801639.1
MSSQPQIPEMSTGVGWYILGQDQQLIGPYTISELQEHHSSAYLHESTLVWAEGCSDWQPLSSVLGLSTGSQQNAPTAVPATSNEEDEFEKWQREVREAEAAAAAEAEAEAEANINDNPERPSTPPEGEEEFTDDDGTTYKWDRTLRAWVPQEETAQKKEDYGLEDMVFVQEEEVFPIVDASDPPVKKEDNDAVAVAVAVEEKQNGKRKLPEESADKKAIEKKEPNKPPESWFDLKVNTHVYVTGLPEDVTIEEMVEVFSK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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