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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G000084`

染色体: Chr03 坐标: 973231-974354 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G000084`
名称	SmilChr03G000084
描述	clavaminate synthase-like protein At3g21360
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	973231 - 974354 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131016969`
GeneID	`131016969`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131016969`
原始查询	`SmilChr03G000084`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	clavaminate synthase-like protein At3g21360
产物	clavaminate synthase-like protein At3g21360
Arabidopsis	`AT3G21360` (AT3G21360) 2-oxoglutarate (2OG) and Fe(II)-dependent oxygenase superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821690] identity=45.9; qcov=0.973; evalue=2.28e-25; confidence=medium
Rice	`Os08g0383800` (B1090H08.29) - identity=82.7; qcov=0.982; evalue=1.59e-63; confidence=high
GO	GO:0016491 (oxidoreductase activity)
KEGG	-
Pfam	PF02668 (TauD)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131016969

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057801804.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057801804.1`
3	Peroxisome	过氧化物酶体	0.20000	`XP_057801804.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057801805.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057801805.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:973338`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A24
`Chr3:973350`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A24
`Chr3:973407`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B17
`Chr3:973425`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B28,B92,C50,C62,C71
`Chr3:973445`	`TCC`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	19	B111,B114,B122,B138,B19,B54,B70,B9,C10,C17,C23,C26,C27,C43,C45,C48,C55,C75,C78
`Chr3:973465`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	36	A13,A4,A6,A8,B108,B109,B112,B119,B128,B18,B22,B25,B30,B35,B36,B38,B43,B48,B55,B66,B72,B77,B80,B83,B88,C14,C22,C35,C36,C42,C59,C7,C74,C79,C81,C9
`Chr3:973494`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A20,C24,C78,C85
`Chr3:973514`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A16,B11,B4,C39
`Chr3:973552`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B61,C76,C85
`Chr3:973559`	`G`	`GA`	1bp_insertion	frameshift_variant	2	B61,C76
`Chr3:973559`	`G`	`GA`	1bp_insertion	CDS_variant	2	B61,C76
`Chr3:973570`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	4	B28,B90,C50,C62

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057801804.1

154 aa

154

TauD

PF02668 TauD 18-123 aa

XP_057801805.1

112 aa

112

TauD

PF02668 TauD 4-81 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057801804.1`	Pfam	`PF02668`	TauD	Domain	18	123	5.5e-13	50.1	Taurine catabolism dioxygenase TauD, TfdA family
`XP_057801805.1`	Pfam	`PF02668`	TauD	Domain	4	81	6.6e-11	43.3	Taurine catabolism dioxygenase TauD, TfdA family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057945822.1
CCGAATCTTGAAGTGCTCGAACTGAGAAAATTCGATTTTGAGGAACAAGAGTGGACAGTTAGTGATCATGATTTCCCAAAGCTGCGATTTCTTCTCATTGATGATTCAAATCTCAAGCAATGGAACACTGACGGCAGCCACTTTCCGTTGCTCGAACACCTACTGATTCATTATTGCCGACGTCTGAGTGAAATTCCAGATAGTATGGGAGAAATTCCGACACTGAAGTTGGTTGAGGTCAAGAGATGTGAGAAATCCCT...

XM_057945821.1
GCTTTCCCTCGATTTTTGACAGGTTAGAGATTTATTGAGTTTGTTGGGTGGTTTCCCTCTCAAGTTTGATGACTGATCTCTGAATTCTTTGACTCAGATTTCATTTTACAAGTATCTCATGTTTCCACTTTATATTTCTAACTCTATCTTCCTTTCCTATTGTATGAAGAATGCCCACGAGTTCGACGACATAGTCGAGGCCTTCGGGTGGGAGGACATACGGTACGTGGGGCCCACCCCGCGCATGCATGTCTACAAGA...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131016969
ATGTTTCCACTTTATATTTCTAACTCTATCTTCCTTTCCTATTGTATGAAGAATGCCCACGAGTTCGACGACATAGTCGAGGCCTTCGGGTGGGAGGACATACGGTACGTGGGGCCCACCCCGCGCATGCATGTCTACAAGAGGGTCTGGACGGCCAACGAAGGTCCCCTGTCGGAGTTCATATACTACCACCATGAGATGGTCTTGATAAAAGAATTCCCAGAGAAGGTGATTCTCTTCTGTGAAGTACCTCCGCCGGA...

LOC131016969
ATGCATGTCTACAAGAGGGTCTGGACGGCCAACGAAGGTCCCCTGTCGGAGTTCATATACTACCACCATGAGATGGTCTTGATAAAAGAATTCCCAGAGAAGGTGATTCTCTTCTGTGAAGTACCTCCGCCGGAAGGAGGAGAAACTCCGATCGCGCCTAGCTTCCGTGTAACGGAGAGGATGTTGGAAGAGTACCCGGAGATGGTGGAAGAGATGGAGAGGAAAGGACTGAGATACACGTTCATGGCCCTAAGCAAAAA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057801804.1
MFPLYISNSIFLSYCMKNAHEFDDIVEAFGWEDIRYVGPTPRMHVYKRVWTANEGPLSEFIYYHHEMVLIKEFPEKVILFCEVPPPEGGETPIAPSFRVTERMLEEYPEMVEEMERKGLRYTFMALSKNDTSSMRGRGWEDAFGTSDCVEAEKS

XP_057801805.1
MHVYKRVWTANEGPLSEFIYYHHEMVLIKEFPEKVILFCEVPPPEGGETPIAPSFRVTERMLEEYPEMVEEMERKGLRYTFMALSKNDTSSMRGRGWEDAFGTSDCVEAEKS

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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