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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G000091`

染色体: Chr03 坐标: 1027224-1029227 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G000091`
名称	SmilChr03G000091
描述	clavaminate synthase-like protein At3g21360
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	1027224 - 1029227 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131016942`
GeneID	`131016942`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131016942`
原始查询	`SmilChr03G000091`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	clavaminate synthase-like protein At3g21360
产物	clavaminate synthase-like protein At3g21360
Arabidopsis	`AT3G21360` (AT3G21360) 2-oxoglutarate (2OG) and Fe(II)-dependent oxygenase superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821690] identity=41.1; qcov=1.03; evalue=9.92e-54; confidence=medium
Rice	`Os08g0383800` (B1090H08.29) - identity=77.7; qcov=1; evalue=3.04e-115; confidence=high
GO	GO:0016491 (oxidoreductase activity)
KEGG	-
Pfam	PF02668 (TauD)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131016942

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057801737.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057801737.1`
3	Peroxisome	过氧化物酶体	0.20000	`XP_057801738.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057801737.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057801737.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:1027427`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B52,C10,C23,C29
`Chr3:1027434`	`CAA`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	C71
`Chr3:1027434`	`CAA`	`C`	2bp_deletion	CDS_variant	1	C71
`Chr3:1027453`	`T`	`TA`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	B105
`Chr3:1027453`	`T`	`TA`	1bp_insertion	CDS_variant	1	B105
`Chr3:1027457`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B13
`Chr3:1027457`	`AG`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B13
`Chr3:1027459`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B8
`Chr3:1027464`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B65
`Chr3:1027469`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B18,B74,C39
`Chr3:1027501`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B115,B126,B91
`Chr3:1027519`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	38	A15,A19,A20,A21,A24,B111,B112,B122,B128,B22,B31,B36,B38,B39,B43,B52,B6,B61,B77,B80,B83,B86,B88,B97,C10,C14,C23,C24,C29,C48,C51,C55,C61,C7,C71,C77,C9,D7

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057801737.1

268 aa

134

268

TauD

PF02668 TauD 18-263 aa

XP_057801738.1

202 aa

101

202

TauD

PF02668 TauD 6-197 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057801737.1`	Pfam	`PF02668`	TauD	Domain	18	263	3.8e-25	90.0	Taurine catabolism dioxygenase TauD, TfdA family
`XP_057801738.1`	Pfam	`PF02668`	TauD	Domain	6	197	1.2e-21	78.6	Taurine catabolism dioxygenase TauD, TfdA family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057945755.1
CAACGTAATACAAGAAAAGCAACAAAATTATGGAGATGATTTTTTTGAAGTTCGTTGTATTAACTGTTAGCCTATCAGAAATCTGCTTTCCCTCGATTTTTGACAGAATGCCCACGAGTTCAACGACATAGTCGAGGCCTTCGGGTGGGAGGACATACGGTACGTGGGGCCCGCCCCGTGCACGCATGTCTACAAGAGGGTCTGGACGGCCAACGAAGGTCCCCTGTCGGAGTTCATATACTACCACCATGAGATGGTCT...

XM_057945754.1
CCCTCTCAAGTTTGATGACTGATATCTGAATTCTTGGACTCAGATTTCATTTTACAAGTATCTCATGTTTCCACTTTATATTTCTAACTCTATCTTCCTTTCCTATTGTATGAAGAATGCCCACGAGTTCAACGACATAGTCGAGGCCTTCGGGTGGGAGGACATACGGTACGTGGGGCCCGCCCCGTGCACGCATGTCTACAAGAGGGTCTGGACGGCCAACGAAGGTCCCCTGTCGGAGTTCATATACTACCACCATG...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131016942
ATGTTTCCACTTTATATTTCTAACTCTATCTTCCTTTCCTATTGTATGAAGAATGCCCACGAGTTCAACGACATAGTCGAGGCCTTCGGGTGGGAGGACATACGGTACGTGGGGCCCGCCCCGTGCACGCATGTCTACAAGAGGGTCTGGACGGCCAACGAAGGTCCCCTGTCGGAGTTCATATACTACCACCATGAGATGGTCTTGATAAAAGAATTCCCAGAGAAGGTGATTCTCTTCTGTGAAGTACCTCCGCCGGA...

LOC131016942
ATGGTCTTGATAAAAGAATTCCCAGAGAAGGTGATTCTCTTCTGTGAAGTACCTCCGCCGGAAGGAGGAGAAACTCCCATCGCGCCTAGCTTCCGTGTAACGGAGAGGATGTTGGAAGAGTACCCGGAGATGGTGGAGGAGATGGAGAGGAAAGGACTGAGATACACGTTCATGGCCCTAACCAAAAACGATGCTTCTTCCATGAGAGGTCGAGGTTGGGAAGATGCATTTGGGACTTCAGATTGCGTAGAAGCAGAGAA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057801737.1
MFPLYISNSIFLSYCMKNAHEFNDIVEAFGWEDIRYVGPAPCTHVYKRVWTANEGPLSEFIYYHHEMVLIKEFPEKVILFCEVPPPEGGETPIAPSFRVTERMLEEYPEMVEEMERKGLRYTFMALTKNDASSMRGRGWEDAFGTSDCVEAEKRGKALGMEMQWLAEGGVKTILGPRPLTRVFEGRKGRRMWFNNVVGMHGNELSSATMADASEIPDEAVKRCQEIIEEESIQFKWQKGDVLFLDNLALLHGRKPSLPPR...

XP_057801738.1
MVLIKEFPEKVILFCEVPPPEGGETPIAPSFRVTERMLEEYPEMVEEMERKGLRYTFMALTKNDASSMRGRGWEDAFGTSDCVEAEKRGKALGMEMQWLAEGGVKTILGPRPLTRVFEGRKGRRMWFNNVVGMHGNELSSATMADASEIPDEAVKRCQEIIEEESIQFKWQKGDVLFLDNLALLHGRKPSLPPRKVLVATCK

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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