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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G000095`

染色体: Chr03 坐标: 1056981-1058228 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G000095`
名称	SmilChr03G000095
描述	putative late blight resistance protein homolog R1B-16
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	1056981 - 1058228 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131015739`
GeneID	`131015739`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131015739`
原始查询	`SmilChr03G000095`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative late blight resistance protein homolog R1B-16
产物	putative late blight resistance protein homolog R1B-16
Arabidopsis	`AT5G43470` (RPP8) Disease resistance protein (CC-NBS-LRR class) family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834367] identity=27.7; qcov=1.13; evalue=1.37e-31; confidence=low
Rice	`Os08g0424700` (P0456B03.103) - identity=28.9; qcov=1.09; evalue=6.74e-34; confidence=low
GO	GO:0006457 (protein folding); GO:0043014 (alpha-tubulin binding)
KEGG	-
Pfam	PF23559 (WHD_DRP); PF23598 (LRR_14)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131015739

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057800144.1`
2	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057800144.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057800144.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057800144.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057800144.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:1056991`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B17
`Chr3:1056999`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A13,B127,B37,C36,D3
`Chr3:1057005`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B42,B85,C40
`Chr3:1057011`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A3,B15,B63,B83,C87
`Chr3:1057034`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C33,D3
`Chr3:1057039`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B17
`Chr3:1057049`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C21,C32,C68
`Chr3:1057056`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D7
`Chr3:1057073`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A9,C62,C71
`Chr3:1057129`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B28
`Chr3:1057136`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	B62,B69
`Chr3:1057136`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B62,B69

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057800144.1

415 aa

208

415

WHD_DRP

LRR_14

PF23559 WHD_DRP 3-75 aa PF23598 LRR_14 129-317 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057800144.1`	Pfam	`PF23559`	WHD_DRP	Domain	3	75	1.8e-18	67.0	Disease resistance protein Winged helix domain
`XP_057800144.1`	Pfam	`PF23598`	LRR_14	Repeat	129	317	7.7e-23	81.5	Leucine-rich repeat region

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057944161.1
ATGGGAATGTTTCCGGAGGATTGTGAGGTCCGTGTCTCAAAACTCACCAAATTATGGGTAGCTGAGGGATTCTTGAGACGTCTGAACAGATCTAAAACCTTCGAAGAAGAGGCTGAAGATTTTTTGGAGGATCTTGTCAAGAGAAATCTTGTTTTGGTTACCAAGAGAAAGTGCGATGGCAGGATCAAAAGTTGCAGCCTCCATGATCTTATGCGAGATTTGTGCATAAGAAAAGCGCATGAAGAGAAGTTTCTTGTGAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131015739
ATGGGAATGTTTCCGGAGGATTGTGAGGTCCGTGTCTCAAAACTCACCAAATTATGGGTAGCTGAGGGATTCTTGAGACGTCTGAACAGATCTAAAACCTTCGAAGAAGAGGCTGAAGATTTTTTGGAGGATCTTGTCAAGAGAAATCTTGTTTTGGTTACCAAGAGAAAGTGCGATGGCAGGATCAAAAGTTGCAGCCTCCATGATCTTATGCGAGATTTGTGCATAAGAAAAGCGCATGAAGAGAAGTTTCTTGTGAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057800144.1
MGMFPEDCEVRVSKLTKLWVAEGFLRRLNRSKTFEEEAEDFLEDLVKRNLVLVTKRKCDGRIKSCSLHDLMRDLCIRKAHEEKFLVNFSSGLSVKGRKNQRRVSFTPLGLPYLSELYGLTIHTILCFHGISVANMLEGFRLLRVLDAGDVYVRSLPDQLFDLFYLAYLAVYYPRRIPTAISKLRNLETLSLHAKNNWRNFRLYLIRLPQEIWRMPRLRHLVFYSRLPNPEGITASSLENLQTLSIVSHTICSERILRMIP...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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