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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G000100`

染色体: Chr03 坐标: 1114004-1116775 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G000100`
名称	SmilChr03G000100
描述	putative late blight resistance protein homolog R1C-3
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	1114004 - 1116775 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131015741`
GeneID	`131015741`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131015741`
原始查询	`SmilChr03G000100`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative late blight resistance protein homolog R1C-3
产物	putative late blight resistance protein homolog R1C-3
Arabidopsis	`AT1G59780` (AT1G59780) NB-ARC domain-containing disease resistance protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842271] identity=25.1; qcov=1.01; evalue=1.22e-57; confidence=low
Rice	`Os07g0186500` - identity=28.6; qcov=0.783; evalue=1.88e-71; confidence=low
GO	GO:0043531 (ADP binding); GO:0098542 (defense response to other organism)
KEGG	-
Pfam	PF00931 (NB-ARC); PF23559 (WHD_DRP)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131015741

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	0.60000	`XP_057800146.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057800146.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057800146.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057800146.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057800146.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:1114025`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B37,B89
`Chr3:1114046`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C29
`Chr3:1114048`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	6	A10,B102,B131,B18,B74,C46
`Chr3:1114064`	`A`	`AGG`	2bp_insertion	frameshift_variant	37	A16,A21,B1,B112,B117,B118,B119,B124,B132,B136,B14,B140,B18,B2,B22,B24,B37,B48,B74,B87,B91,C15,C28,C3,C4,C49,C52,C54,C59,C63,C66,C74,C78,C79,D11,D4,D7
`Chr3:1114065`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	37	A16,A21,B1,B112,B117,B118,B119,B124,B132,B136,B14,B140,B18,B2,B22,B24,B37,B48,B74,B87,B91,C15,C28,C3,C4,C49,C52,C54,C59,C63,C66,C74,C78,C79,D11,D4,D7
`Chr3:1114081`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	C6
`Chr3:1114081`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C6
`Chr3:1114140`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A5,B62,B75
`Chr3:1114150`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B133
`Chr3:1114162`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B122
`Chr3:1114237`	`T`	`TTA`	2bp_insertion	frameshift_variant	3	A14,C33,D10
`Chr3:1114237`	`T`	`TTA`	2bp_insertion	CDS_variant	3	A14,C33,D10

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057800146.1

923 aa

462

923

NB-ARC

WHD_DRP

PF00931 NB-ARC 176-343 aa PF23559 WHD_DRP 430-501 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057800146.1`	Pfam	`PF00931`	NB-ARC	Domain	176	343	2.3e-42	145.2	NB-ARC domain
`XP_057800146.1`	Pfam	`PF23559`	WHD_DRP	Domain	430	501	2.7e-14	53.6	Disease resistance protein Winged helix domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057944163.1
ATGGCGGCCTACGCAGCCTTGGTTTCTCTAATGCATATCATAGACGACCTCGAGCGCCACCATTCCCCTCCGATTTCTCTCAACAAACAACAAGTTCAATCCCTCACTGAAAATGTCACGTACTTGCAGGAGTTTCTCGAAGCTTATATCTCCCCTGTTTCCGACGACGCAGATCCCTTGGAGATGCGTATTGCAGATGCAGCTTATGCAGCTGAAGACGCCATCGAATCTCATATCGTGGCCAAGATTCAGCTGAGCAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131015741
ATGGCGGCCTACGCAGCCTTGGTTTCTCTAATGCATATCATAGACGACCTCGAGCGCCACCATTCCCCTCCGATTTCTCTCAACAAACAACAAGTTCAATCCCTCACTGAAAATGTCACGTACTTGCAGGAGTTTCTCGAAGCTTATATCTCCCCTGTTTCCGACGACGCAGATCCCTTGGAGATGCGTATTGCAGATGCAGCTTATGCAGCTGAAGACGCCATCGAATCTCATATCGTGGCCAAGATTCAGCTGAGCAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057800146.1
MAAYAALVSLMHIIDDLERHHSPPISLNKQQVQSLTENVTYLQEFLEAYISPVSDDADPLEMRIADAAYAAEDAIESHIVAKIQLSRSREAYNSPVSDEADPEDPKTVSSNHDDDDEEMNLFQDVQNVIQEMDQIKSLAMQRNTEKVVLHDTRRSFISASSSTEKNNSGMVVWSEGVVNGILERLVSDQRERQVIPITGMGGIGKTTLAKTVYSKKIIEQRFDVRAWATISQQYNTREILCELVSQATNKSKEQLSEKSE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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