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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G000115`

染色体: Chr03 坐标: 1276406-1279246 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G000115`
名称	SmilChr03G000115
描述	late blight resistance protein R1-A-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	1276406 - 1279246 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131015748`
GeneID	`131015748`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131015748`
原始查询	`SmilChr03G000115`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	late blight resistance protein R1-A-like
产物	late blight resistance protein R1-A-like
Arabidopsis	`AT1G59780` (AT1G59780) NB-ARC domain-containing disease resistance protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842271] identity=26.8; qcov=0.849; evalue=1.08e-58; confidence=low
Rice	`Os07g0186500` - identity=30; qcov=0.743; evalue=9.63e-71; confidence=low
GO	GO:0043531 (ADP binding); GO:0098542 (defense response to other organism)
KEGG	-
Pfam	PF00931 (NB-ARC); PF13401 (AAA_22); PF23559 (WHD_DRP)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131015748

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	0.80000	`XP_057800153.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057800153.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057800153.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057800153.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057800153.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:1276468`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B65
`Chr3:1276543`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C75,C80
`Chr3:1276575`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C43
`Chr3:1276619`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	C28
`Chr3:1276619`	`C`	`CA`	1bp_insertion	CDS_variant	1	C28
`Chr3:1276623`	`GAC`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	C28
`Chr3:1276623`	`GAC`	`G`	2bp_deletion	CDS_variant	1	C28
`Chr3:1276625`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B30,B67
`Chr3:1276655`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C34
`Chr3:1276690`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B31
`Chr3:1276695`	`TCC`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	19	A16,B105,B119,B13,B138,B20,B21,B26,B32,B44,B64,B79,B98,C24,C38,C49,C57,C72,C87
`Chr3:1276702`	`ACC`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	3	B79,B80,C52

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057800153.1

946 aa

473

946

NB-ARC

AAA_22

WHD_DRP

PF00931 NB-ARC 237-399 aa PF13401 AAA_22 248-338 aa PF23559 WHD_DRP 485-555 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057800153.1`	Pfam	`PF00931`	NB-ARC	Domain	237	399	7.6e-38	130.5	NB-ARC domain
`XP_057800153.1`	Pfam	`PF13401`	AAA_22	Domain	248	338	9.4e-08	33.2	AAA domain
`XP_057800153.1`	Pfam	`PF23559`	WHD_DRP	Domain	485	555	8.7e-18	64.9	Disease resistance protein Winged helix domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057944170.1
ATGGCAGCATATGCAGCCTTGGTTTCTGTTATGCATATCATCGATACAATCGAGCATCACCATTCCCCTCCAATTTCTATCCACAAACAACAAGTTGAATCTCTCACACAAATTCTTACCTTTTTGCAGGAATTTCTTGAAGGTTATAAGTCCCCTGTTGCTGACGGAGATGAATCTGATCCGCTGGAGATGCGTATCGCAGATTTAGCTTATGCGGCTGAAGATGTTATCGAATCACATATTGTGAACAAGCTTCAGCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131015748
ATGGCAGCATATGCAGCCTTGGTTTCTGTTATGCATATCATCGATACAATCGAGCATCACCATTCCCCTCCAATTTCTATCCACAAACAACAAGTTGAATCTCTCACACAAATTCTTACCTTTTTGCAGGAATTTCTTGAAGGTTATAAGTCCCCTGTTGCTGACGGAGATGAATCTGATCCGCTGGAGATGCGTATCGCAGATTTAGCTTATGCGGCTGAAGATGTTATCGAATCACATATTGTGAACAAGCTTCAGCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057800153.1
MAAYAALVSVMHIIDTIEHHHSPPISIHKQQVESLTQILTFLQEFLEGYKSPVADGDESDPLEMRIADLAYAAEDVIESHIVNKLQLSRSKEAKIDTAYIAEDAVESHIVDKVQLRRSKEAKISCFFNCFGGSKNDSSNHDDEHINLYQDHGKKEAMETAAAADEGDAVGEDVSCIDFYEDLQQVIEEMNVIKKKAMETAAEAQLQRKVSSTHAGSLTSSSNVKESMMVGFDDVQLQLLDWLTGGNRNRQIIPITGMSGI...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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