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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G000119`

染色体: Chr03 坐标: 1298885-1300507 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G000119`
名称	SmilChr03G000119
描述	uncharacterized SmilChr03G000119
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	1298885 - 1300507 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131015750`
GeneID	`131015750`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131015750`
原始查询	`SmilChr03G000119`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Ribosomal protein S5 family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842796]; symbol=AT1G64880; hit=AT1G64880; species=arabidopsis; confidence=high
产物	Ribosomal protein S5 family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842796]; symbol=AT1G64880; hit=AT1G64880; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT1G64880` (AT1G64880) Ribosomal protein S5 family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842796] identity=78.9; qcov=0.948; evalue=1.16e-59; confidence=high
Rice	`Os02g0102400` - identity=72.1; qcov=0.965; evalue=9.04e-55; confidence=high
GO	GO:0003723 (RNA binding); GO:0003735 (structural constituent of ribosome); GO:0005840 (ribosome); GO:0006412 (translation)
KEGG	-
Pfam	PF03719 (Ribosomal_S5_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131015750

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	0.40000	`XP_057800156.1`
2	Chloroplast	叶绿体	0.40000	`XP_057800156.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057800156.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057800156.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057800156.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:1299927`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B123,C35
`Chr3:1299937`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B17
`Chr3:1299937`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B17
`Chr3:1299959`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B85
`Chr3:1299995`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B111,B30,B67,C17,C76
`Chr3:1299999`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B100,B122,B20,C71,D9
`Chr3:1300307`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B109
`Chr3:1300334`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B109
`Chr3:1300481`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C8
`Chr3:1300481`	`AC`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C8

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057800156.1

115 aa

115

Ribosomal_S5_C

PF03719 Ribosomal_S5_C 37-104 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057800156.1`	Pfam	`PF03719`	Ribosomal_S5_C	Domain	37	104	1.2e-21	76.6	Ribosomal protein S5, C-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057944173.1
ATGGAAAAATTGCAAACTCTTTCGATGGCATATGAGAAGTGCTTTCAGAATCTGCATTATGTAGAGCGGCATGAGGATCATACAATTGCACATGCAATTCAGACATCGTATAAAAAGACTAAGGTGTATCTTTGGCCAGCTCCTACACAATCAGGGATGAAGGCAGGCAAAACTGTGGAGTTGATTCTTAACTTAACTGGTTACAGAAATGTGAAATCAAAGGTTGTTGGTTCAAGGAATCCCCACAACACTGTGAAGGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131015750
ATGGAAAAATTGCAAACTCTTTCGATGGCATATGAGAAGTGCTTTCAGAATCTGCATTATGTAGAGCGGCATGAGGATCATACAATTGCACATGCAATTCAGACATCGTATAAAAAGACTAAGGTGTATCTTTGGCCAGCTCCTACACAATCAGGGATGAAGGCAGGCAAAACTGTGGAGTTGATTCTTAACTTAACTGGTTACAGAAATGTGAAATCAAAGGTTGTTGGTTCAAGGAATCCCCACAACACTGTGAAGGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057800156.1
MEKLQTLSMAYEKCFQNLHYVERHEDHTIAHAIQTSYKKTKVYLWPAPTQSGMKAGKTVELILNLTGYRNVKSKVVGSRNPHNTVKALFKALNAIETPKDVQEKFGRTVVESYLL

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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