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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G000127`

染色体: Chr03 坐标: 1394077-1402930 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G000127`
名称	SmilChr03G000127
描述	receptor-like protein 35
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	1394077 - 1402930 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131016974`
GeneID	`131016974`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131016974`
原始查询	`SmilChr03G000127`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	receptor-like protein 35
产物	receptor-like protein 35
Arabidopsis	`AT3G11080` (RLP35) receptor like protein 35 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820279] identity=56.5; qcov=0.892; evalue=5.26e-31; confidence=medium
Rice	`Os08g0117700` - identity=46.8; qcov=0.892; evalue=1.71e-28; confidence=medium
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF00560 (LRR_1); PF13855 (LRR_8); PF23598 (LRR_14)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131016974

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	0.60000	`XP_057801813.1`
2	Secreted	分泌到胞外	0.20000	`XP_057801813.1`
3	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	0.20000	`XP_057801813.1`
4	Vacuole	液泡	0.20000	`XP_057801813.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057801813.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:1394736`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C48
`Chr3:1394744`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	9	B120,B137,B39,B90,B92,C20,C28,C56,D3
`Chr3:1401142`	`AAG`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	C62
`Chr3:1401142`	`AAG`	`A`	2bp_deletion	CDS_variant	1	C62
`Chr3:1401161`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B60
`Chr3:1401183`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C8
`Chr3:1402349`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A3,B60,C25
`Chr3:1402637`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C3,C4,C72

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057801813.1

139 aa

139

LRR_14

LRR_1

LRR_8

LRR_1

LRR_8

LRR_1

PF23598 LRR_14 6-71 aa PF00560 LRR_1 16-38 aa PF13855 LRR_8 16-75 aa PF00560 LRR_1 40-62 aa PF00560 LRR_1 64-86 aa PF13855 LRR_8 83-123 aa PF00560 LRR_1 89-110 aa PF00560 LRR_1 112-125 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057801813.1`	Pfam	`PF23598`	LRR_14	Repeat	6	71	8.6e-19	68.2	Leucine-rich repeat region
`XP_057801813.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	16	38	1.5e-18	63.6	Leucine Rich Repeat
`XP_057801813.1`	Pfam	`PF13855`	LRR_8	Repeat	16	75	1.3e-16	60.8	Leucine rich repeat
`XP_057801813.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	40	62	1.5e-18	63.6	Leucine Rich Repeat
`XP_057801813.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	64	86	1.5e-18	63.6	Leucine Rich Repeat
`XP_057801813.1`	Pfam	`PF13855`	LRR_8	Repeat	83	123	1.3e-16	60.8	Leucine rich repeat
`XP_057801813.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	89	110	1.5e-18	63.6	Leucine Rich Repeat
`XP_057801813.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	112	125	1.5e-18	63.6	Leucine Rich Repeat

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XR_009099285.1
ACTCACAATATGGATACATTTTCCCCATTTTTCCTTGTTTCGCTTCTCTTATTGTTTTCTTGACTTAGCATTTTTGCTTCACAGAACGCAACTCAAAACAAAAGTGATGAATCTATACTTTTTGTCTTAAAATCCCACATCACTTCGGATCCTTCCAATATTTTGAAAAATAATTGGACAAGTGGAACCTCGTTTTGCACATGGATAGGAGTTACTTGTGATTCACTTCGTAGTAGGGTGACTAAATTAGATATCTCTGT...

XM_057945830.1
ACTCACAATATGGATACATTTTCCCCATTTTTCCTTGTTTCGCTTCTCTTATTGTTTTCTTGACTTAGCATTTTTGCTTCACAGAACGCAACTCAAAACAAAAGTGATGAATCTATACTTTTTGTCTTAAAATCCCACATCACTTCGGATCCTTCCAATATTTTGAAAAATAATTGGACAAGTGGAACCTCGTTTTGCACATGGATAGGAGTTACTTGTGATTCACTTCGTAGTAGGGTGACTAAATTAGATATCTCTGT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131016974
ATGGAACTCGAAGGAAGCATTCCACAGGAAATCGGAAATCTTTCTTCTCTTGTTTTTCTAGATTTGAGTTGGAACTCTTTTCATGGTACAATACCATCCACCGTTGGGAATCTATCAAATCTGCAGGTCCTATACCTCTCGTCCAACAAATTAAATGGTACAATACCATCCACCATTGGGAATCTATCAAATCTGCAGTTACTATATCTCTCTTCCAATGAATTAAATGGTCCAATACCATTCACCATTGGAAATTTACC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057801813.1
MELEGSIPQEIGNLSSLVFLDLSWNSFHGTIPSTVGNLSNLQVLYLSSNKLNGTIPSTIGNLSNLQLLYLSSNELNGPIPFTIGNLPYLVSLELSSNKLNGPIPSTIGNLSNLEYLLLSSNRLNGFEWLSQREVEGSYK

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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