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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G000147`

染色体: Chr03 坐标: 1614522-1615370 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G000147`
名称	SmilChr03G000147
描述	receptor-like protein 9DC3
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	1614522 - 1615370 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131015755`
GeneID	`131015755`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131015755`
原始查询	`SmilChr03G000147`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	receptor-like protein 9DC3
产物	receptor-like protein 9DC3
Arabidopsis	`AT2G33060` (RLP27) receptor like protein 27 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817868] identity=42.3; qcov=0.989; evalue=5.18e-61; confidence=medium
Rice	`Os12g0221700` - identity=44.2; qcov=0.947; evalue=1.68e-63; confidence=medium
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF00560 (LRR_1); PF13516 (LRR_6)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131015755

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057800163.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057800163.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057800163.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057800163.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057800163.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:1614716`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A7
`Chr3:1614732`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B128,C29,C31,C41,C82
`Chr3:1614763`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B128
`Chr3:1614765`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B128,C29,C31,C82
`Chr3:1614767`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B128,C29,C31,C82
`Chr3:1614772`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C29
`Chr3:1614795`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B127,B31,B63
`Chr3:1614904`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A5,B32,C23,C29
`Chr3:1614962`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C37
`Chr3:1615086`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr3:1615101`	`T`	`TTG`	2bp_insertion	frameshift_variant	30	A16,A3,B102,B120,B124,B126,B2,B42,B43,B49,B54,B66,B87,B9,C1,C14,C16,C18,C28,C33,C42,C58,C61,C63,C82,C86,C9,D1,D3,D4
`Chr3:1615102`	`AAG`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	29	A16,A3,B102,B120,B124,B126,B2,B42,B43,B49,B54,B66,B87,B9,C1,C14,C16,C18,C28,C33,C42,C58,C61,C82,C86,C9,D1,D3,D4

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057800163.1

282 aa

141

282

LRR_1

LRR_6

LRR_1

PF00560 LRR_1 102-122 aa PF13516 LRR_6 123-136 aa PF00560 LRR_1 124-145 aa PF00560 LRR_1 149-170 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057800163.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	102	122	6.6e-20	67.6	Leucine Rich Repeat
`XP_057800163.1`	Pfam	`PF13516`	LRR_6	Repeat	123	136	4.1e-08	33.4	Leucine Rich repeat
`XP_057800163.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	124	145	6.6e-20	67.6	Leucine Rich Repeat
`XP_057800163.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	149	170	6.6e-20	67.6	Leucine Rich Repeat

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057944180.1
ATGGAAGCTCTTCCTGAGCTTCGAGTGCTCGTCTTGAAGTCTAACAAGTTTGATGGTAACATGTCGTTGGCTTCACGAAGCAACCTTCCATTTCCGAAGTTGCAAGTTTTAGATATATCAGAGAACGAATTTGTGGGGTCTCTACCTCGAAAATATTTCAAAAATTTCAGAGCAATGATGGATGTGAAGGAAAATCAAAAAGAAAGATACAATAATAATGATTCGCAATTTCAAGCTTTCGTGGAGATGACAATCACCTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131015755
ATGGAAGCTCTTCCTGAGCTTCGAGTGCTCGTCTTGAAGTCTAACAAGTTTGATGGTAACATGTCGTTGGCTTCACGAAGCAACCTTCCATTTCCGAAGTTGCAAGTTTTAGATATATCAGAGAACGAATTTGTGGGGTCTCTACCTCGAAAATATTTCAAAAATTTCAGAGCAATGATGGATGTGAAGGAAAATCAAAAAGAAAGATACAATAATAATGATTCGCAATTTCAAGCTTTCGTGGAGATGACAATCACCTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057800163.1
MEALPELRVLVLKSNKFDGNMSLASRSNLPFPKLQVLDISENEFVGSLPRKYFKNFRAMMDVKENQKERYNNNDSQFQAFVEMTITLKGLDQLLKRLLQTFTIIDLSSNNFSGRIPDSIGNLNSLRYLNLSHNNLTGHIPASLGNISVLESLDLSSNKLEGGIPSELTSLTFLAKLNLSMNDLVGQIPQSSQFSTFENDSYVGNLRLCGVPLTRKCNEENEQRMQPEEEEDEEYGFIDGFGWRSVVMGYGSGMIVGIGIG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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