当前解析结果
SmilChr03G000153| 统一新 Gene ID | SmilChr03G000153 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr03G000153 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr03G000153 |
| 染色体 / SeqID | Chr03 / NC_080389.1 |
| 坐标与链方向 | 1654095 - 1654571 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131015758 |
|---|---|
| GeneID | 131015758 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131015758 |
| 原始查询 | SmilChr03G000153 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131015758 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057800166.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.60000 | XP_057800166.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057800166.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057800166.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057800166.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr3:1654101 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A13,B131,B31 |
Chr3:1654102 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B131,B31,B95 |
Chr3:1654121 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C5 |
Chr3:1654125 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 12 | A13,A25,B12,B120,B121,B126,B72,B89,C1,C20,C27,C52 |
Chr3:1654131 |
C |
CTA |
2bp_insertion | frameshift_variant | 1 | C1 |
Chr3:1654131 |
C |
CTA |
2bp_insertion | CDS_variant | 1 | C1 |
Chr3:1654132 |
ATC |
A |
2bp_deletion | frameshift_variant | 1 | C1 |
Chr3:1654132 |
ATC |
A |
2bp_deletion | CDS_variant | 1 | C1 |
Chr3:1654148 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B15,B91,C23 |
Chr3:1654170 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | A7,B72 |
Chr3:1654532 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B136,B80 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。