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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G000165`

染色体: Chr03 坐标: 1813038-1815359 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G000165`
名称	SmilChr03G000165
描述	laccase-15-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	1813038 - 1815359 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131016857`
GeneID	`131016857`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131016857`
原始查询	`SmilChr03G000165`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	laccase-15-like
产物	laccase-15-like
Arabidopsis	`AT5G09360` (LAC14) laccase 14 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830795] identity=45.3; qcov=0.977; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os02g0749700` (OsLAC10) - identity=49.6; qcov=0.977; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005507 (copper ion binding); GO:0046274 (lignin catabolic process); GO:0048046 (apoplast); GO:0052716 (hydroquinone:oxygen oxidoreductase activity)
KEGG	-
Pfam	PF00394 (Cu-oxidase); PF07731 (Cu-oxidase_2); PF07732 (Cu-oxidase_3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131016857

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	1.00000	`XP_057801620.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057801620.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057801620.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057801620.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057801620.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:1813200`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B20,B34,C18,C2
`Chr3:1813269`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B114,B128,B46
`Chr3:1813318`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B107,B122,C73
`Chr3:1813435`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B65,C6
`Chr3:1813499`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C43,C8
`Chr3:1813541`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B114,C41
`Chr3:1813631`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B48,B69,C31,C35,D2
`Chr3:1813637`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A21
`Chr3:1813646`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B57,B83,C40,C5,C66
`Chr3:1813703`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A10,D10,D5
`Chr3:1813744`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr3:1813771`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B46,B75,C86

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057801620.1

571 aa

286

571

Cu-oxidase_3

Cu-oxidase

Cu-oxidase_2

PF07732 Cu-oxidase_3 29-143 aa PF00394 Cu-oxidase 155-303 aa PF07731 Cu-oxidase_2 408-543 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057801620.1`	Pfam	`PF07732`	Cu-oxidase_3	Domain	29	143	1e-39	136.0	Multicopper oxidase
`XP_057801620.1`	Pfam	`PF00394`	Cu-oxidase	Domain	155	303	1.7e-35	123.2	Multicopper oxidase
`XP_057801620.1`	Pfam	`PF07731`	Cu-oxidase_2	Domain	408	543	3.6e-41	140.9	Multicopper oxidase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057945637.1
AGGAGATGTAAGCTAGAAAAGGAAATTAATTCATAGTACACACCACTCAAAAAAATGTCTTGTTATAGGAAGCTCAAGGTTTTCATCCTGTGTATTATTATGGCTCCAGTCGATGCTTTAGTTCATCATAAGTTTGAAGTGAGAAGAACTTCACACACAAGGCTATGCACCACCAAAAGCATGCTAACCGTAAACGGGCAGTTCCCAGGGCCAACTATATATGCTAGAAGGGGGGAATTGGTGGTAATCGATGTTATTAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131016857
ATGTCTTGTTATAGGAAGCTCAAGGTTTTCATCCTGTGTATTATTATGGCTCCAGTCGATGCTTTAGTTCATCATAAGTTTGAAGTGAGAAGAACTTCACACACAAGGCTATGCACCACCAAAAGCATGCTAACCGTAAACGGGCAGTTCCCAGGGCCAACTATATATGCTAGAAGGGGGGAATTGGTGGTAATCGATGTTATTAATCGCGCCGACGCAAATATAAGTATCCATTGGCATGGAGTAAAAATGCCGAGATA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057801620.1
MSCYRKLKVFILCIIMAPVDALVHHKFEVRRTSHTRLCTTKSMLTVNGQFPGPTIYARRGELVVIDVINRADANISIHWHGVKMPRYPWTDGASHVTQCPISPGKRFRQRMLLSNEEGTLFWHAHSDWSRATVYGAIIILPPKTHTYPFPKPHAEVPILLGEWWNADVQQVYEDAIAQGIDANFSDAFLMNGQPGDMYPCSKQDTFKLSVEPGKTYLIRMINAMLSYIMYLKIKDHNVTVVGMDGAYTKPLDTDHIAIAP...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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