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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G000169`

染色体: Chr03 坐标: 1864899-1867457 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G000169`
名称	SmilChr03G000169
描述	putative late blight resistance protein homolog R1A-3
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	1864899 - 1867457 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131015765`
GeneID	`131015765`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131015765`
原始查询	`SmilChr03G000169`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative late blight resistance protein homolog R1A-3
产物	putative late blight resistance protein homolog R1A-3
Arabidopsis	`AT5G48620` (AT5G48620) Disease resistance protein (CC-NBS-LRR class) family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834919] identity=24; qcov=0.983; evalue=3.76e-24; confidence=weak
Rice	`Os12g0564800` - identity=27.4; qcov=1.05; evalue=1.44e-27; confidence=low
GO	GO:0043531 (ADP binding); GO:0098542 (defense response to other organism)
KEGG	-
Pfam	PF00931 (NB-ARC); PF23559 (WHD_DRP)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131015765

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	0.60000	`XP_057800173.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057800173.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057800173.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057800173.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057800173.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:1864930`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B133,B59
`Chr3:1864932`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	19	B108,B122,B13,B131,B133,B14,B45,B59,B67,B78,B87,C15,C31,C36,C4,C49,C72,C81,D10
`Chr3:1864934`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C37,C68
`Chr3:1864948`	`A`	`AC`	1bp_insertion	frameshift_variant	2	C4,C60
`Chr3:1864948`	`A`	`AC`	1bp_insertion	CDS_variant	2	C4,C60
`Chr3:1865117`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C61
`Chr3:1865271`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A21
`Chr3:1865473`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B36
`Chr3:1865499`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B79,C25
`Chr3:1865549`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B36,B46
`Chr3:1865553`	`AAG`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	4	B140,B46,B85,C3
`Chr3:1865553`	`AAG`	`A`	2bp_deletion	CDS_variant	4	B140,B46,B85,C3

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057800173.1

360 aa

180

360

NB-ARC

WHD_DRP

PF00931 NB-ARC 13-90 aa PF23559 WHD_DRP 146-197 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057800173.1`	Pfam	`PF00931`	NB-ARC	Domain	13	90	8.1e-20	71.8	NB-ARC domain
`XP_057800173.1`	Pfam	`PF23559`	WHD_DRP	Domain	146	197	6.7e-09	36.4	Disease resistance protein Winged helix domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057944190.1
ATGGGCCGTCCACAGTCTGGGCTTGAGCTTCCTCAGCAACGGTTGTATCATCGGAGGTATCTTATTGTAATGGACGACATGTGGAGTAAGAAAGCTTGGGATGATGTAAGGATGTTGTTTCCTGACTCAGGTAATAGCAGTTGGATCATAGTAACCACAAGGCTGCATGATGTGGCTGCTTATGTCGACTCTTCTAGTTCCATTCATACTATGAGTGTGTTGGATGCACATCATAGTTGGAATTTGCTAGAGCAGAAGGT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131015765
ATGGGCCGTCCACAGTCTGGGCTTGAGCTTCCTCAGCAACGGTTGTATCATCGGAGGTATCTTATTGTAATGGACGACATGTGGAGTAAGAAAGCTTGGGATGATGTAAGGATGTTGTTTCCTGACTCAGGTAATAGCAGTTGGATCATAGTAACCACAAGGCTGCATGATGTGGCTGCTTATGTCGACTCTTCTAGTTCCATTCATACTATGAGTGTGTTGGATGCACATCATAGTTGGAATTTGCTAGAGCAGAAGGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057800173.1
MGRPQSGLELPQQRLYHRRYLIVMDDMWSKKAWDDVRMLFPDSGNSSWIIVTTRLHDVAAYVDSSSSIHTMSVLDAHHSWNLLEQKVFAGTYFPIELKDIGKKIVQNCGGLPLSIVVVAELLSKVYTRSSWEQIAANDEQLESIIGFVTLSNGSKSLEEEAEDCFEDLVERSLVLVANRKFDGKIKSCSLHDIVREFCVRQAAKEKALSLARDLVYSKRMVEMIPNIKKLGICYSKEKFDANAGYCLDNLNLFCQLEKLK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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