当前解析结果
SmilChr03G000201| 统一新 Gene ID | SmilChr03G000201 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr03G000201 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr03G000201 |
| 染色体 / SeqID | Chr03 / NC_080389.1 |
| 坐标与链方向 | 2282683 - 2287094 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131016847 |
|---|---|
| GeneID | 131016847 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131016847 |
| 原始查询 | SmilChr03G000201 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131016847 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cell membrane | 细胞膜 | 0.80000 | XP_057801605.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.60000 | XP_057801604.1 |
| 3 | Cytosol | 细胞质基质 | 0.20000 | XP_057801604.1 |
| 4 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057801604.1 |
| 5 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057801604.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr3:2282882 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B135,B17,B45,C13,C48 |
Chr3:2282903 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B13 |
Chr3:2282916 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A2,B117,B118 |
Chr3:2282959 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B69,C38,C65 |
Chr3:2282984 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B100,B16,C44,C80,D5 |
Chr3:2283019 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A9,B131,C18,C2 |
Chr3:2283020 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B108 |
Chr3:2283128 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A14,B51,C41,C73 |
Chr3:2283245 |
G |
GGC |
2bp_insertion | frameshift_variant | 59 | A19,A20,B101,B105,B111,B113,B121,B129,B132,B134,B139,B21,B28,B42,B43,B44,B52,B54,B69,B7,B72,B79,B89,B90,B97,B99,C1,C10,C15,C17,C2,C23,C26,C27,C30,C31,C32,C35,C41,C43,C48,C5,C50,C51,C52,C56,C61,C68,C7,C70,C73,C74,C76,C77,C8,C82,C86,C87,C9 |
Chr3:2283261 |
GAA |
G |
2bp_deletion | frameshift_variant | 9 | B124,B133,B137,B56,C23,C25,C64,C66,D9 |
Chr3:2283272 |
AGC |
A |
2bp_deletion | frameshift_variant | 36 | A19,A20,B101,B111,B121,B129,B132,B19,B28,B42,B43,B54,B69,B7,B76,B97,C1,C15,C32,C43,C48,C50,C51,C52,C56,C61,C68,C7,C70,C74,C77,C8,C82,C86,C87,C9 |
Chr3:2283275 |
T |
TTG |
2bp_insertion | stop_gained,frameshift_variant | 40 | A19,A20,B101,B111,B121,B129,B132,B19,B28,B42,B43,B54,B69,B7,B72,B76,B97,C1,C15,C26,C31,C32,C35,C43,C48,C50,C51,C52,C56,C61,C68,C7,C70,C74,C77,C8,C82,C86,C87,C9 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
4 records
下载 cDNA FASTA2 records
下载 CDS FASTA2 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。