当前解析结果
SmilChr03G000203| 统一新 Gene ID | SmilChr03G000203 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr03G000203 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr03G000203 |
| 染色体 / SeqID | Chr03 / NC_080389.1 |
| 坐标与链方向 | 2298339 - 2302432 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131016850 |
|---|---|
| GeneID | 131016850 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131016850 |
| 原始查询 | SmilChr03G000203 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131016850 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.80000 | XP_057801609.1 |
| 2 | Nucleus | 细胞核 | 0.20000 | XP_057801609.1 |
| 3 | Cytosol | 细胞质基质 | 0.20000 | XP_057801610.1 |
| 4 | Cell membrane | 细胞膜 | 0.20000 | XP_057801610.1 |
| 5 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057801609.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr3:2298462 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C23 |
Chr3:2298463 |
C |
CGA |
2bp_insertion | frameshift_variant | 3 | B11,C1,D3 |
Chr3:2298463 |
C |
CGA |
2bp_insertion | CDS_variant | 3 | B11,C1,D3 |
Chr3:2298472 |
C |
CT |
1bp_insertion | frameshift_variant | 30 | A18,A20,A7,B1,B103,B106,B110,B120,B123,B124,B139,B33,B41,B53,B59,B8,B87,B9,B93,B99,C10,C16,C32,C42,C53,C68,C69,C7,C74,C77 |
Chr3:2298474 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B105,B22,B6,B96 |
Chr3:2298497 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B135,B23,C48,C85 |
Chr3:2298503 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B126,C21 |
Chr3:2298510 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B2 |
Chr3:2298519 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A16,B140,B81,B9,C27 |
Chr3:2298532 |
C |
CAG |
2bp_insertion | frameshift_variant | 191 | A1,A10,A11,A13,A14,A15,A18,A19,A2,A20,A21,A23,A24,A25,A3,A4,A5,A7,A9,B101,B102,B103,B104,B105,B106,B107,B108,B109,B11,B110,B111,B112,B113,B114,B118,B119,B120,B121,B122,B123,B124,B125,B127,B128,B13,B130,B132,B135,B136,B138,B139,B14,B140,B15,B17,B18,B19,B2,B21,B22,B23,B24,B26,B27,B28,B32,B33,B34,B35,B36,B37,B39,B4,B40,B41,B45,B46,B5,B50,B51,B52,B53,B55,B57,B58,B59,B6,B61,B63,B64,B65,B66,B67,B69,B7,B73,B74,B75,B76,B78,B79,B8,B80,B81,B83,B84,B86,B87,B88,B9,B91,B93,B94,B95,B97,B98,C1,C10,C11,C13,C14,C16,C17,C18,C2,C20,C22,C23,C24,C25,C27,C29,C3,C30,C31,C32,C34,C36,C37,C38,C4,C40,C42,C43,C45,C46,C47,C48,C49,C5,C50,C51,C52,C53,C54,C55,C58,C59,C6,C60,C61,C62,C63,C64,C65,C66,C67,C68,C69,C7,C70,C72,C73,C74,C75,C76,C77,C78,C79,C81,C82,C83,C87,D1,D10,D2,D3,D4,D6,D8,D9 |
Chr3:2298553 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B100,B24,C38 |
Chr3:2298559 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B117,B31,B34 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
8 records
下载 cDNA FASTA2 records
下载 CDS FASTA2 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。