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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G000206`

染色体: Chr03 坐标: 2364357-2367604 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G000206`
名称	SmilChr03G000206
描述	putative late blight resistance protein homolog R1A-10
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	2364357 - 2367604 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131016849`
GeneID	`131016849`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131016849`
原始查询	`SmilChr03G000206`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative late blight resistance protein homolog R1A-10
产物	putative late blight resistance protein homolog R1A-10
Arabidopsis	`AT1G50180` (AT1G50180) NB-ARC domain-containing disease resistance protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841440] identity=29.9; qcov=0.957; evalue=1.23e-69; confidence=low
Rice	`Os08g0424700` (P0456B03.103) - identity=30.4; qcov=0.973; evalue=9.72e-84; confidence=low
GO	GO:0043531 (ADP binding); GO:0098542 (defense response to other organism)
KEGG	-
Pfam	PF00931 (NB-ARC); PF23559 (WHD_DRP)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131016849

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057801607.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057801607.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057801607.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057801607.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057801607.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:2365234`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A10,C26,C36
`Chr3:2365242`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B137,C14,C24,C31,C85
`Chr3:2365248`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	6	A4,A7,A8,B34,C20,C27
`Chr3:2365264`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B98,C43,C49,C58,D2
`Chr3:2365281`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B108,C31,C81
`Chr3:2365413`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C58
`Chr3:2365442`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A3,B14,B37,C24
`Chr3:2365476`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B52,C23
`Chr3:2365478`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C76
`Chr3:2365479`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B134,B6
`Chr3:2365488`	`AGC`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	2	B28,C29
`Chr3:2365488`	`AGC`	`A`	2bp_deletion	CDS_variant	2	B28,C29

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057801607.1

667 aa

334

667

NB-ARC

WHD_DRP

PF00931 NB-ARC 158-324 aa PF23559 WHD_DRP 405-477 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057801607.1`	Pfam	`PF00931`	NB-ARC	Domain	158	324	6.8e-43	146.9	NB-ARC domain
`XP_057801607.1`	Pfam	`PF23559`	WHD_DRP	Domain	405	477	1.6e-17	64.0	Disease resistance protein Winged helix domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057945624.1
CAATTAATAAATTAATTTTGAAATTTGGGGTTCAATTATTAATTCAAAATTAATAAAAGATTTTTTTTTTTTTTTTATGTCACATCCCCAAATGGGCATTTAATAAAATGCAGGCCCAGCCCCATTTATTATGTCAATTTCGCAACCCATGGAAGTCCACAGCAGCAGCCCACAAAAGGAACAGGCCCAGCCTTTGAACACTGCAGCCCAACAACTCCTCTTGGCCCAAAACCCAATTTTCAGCAGCAAGGGTTTGAGAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131016849
ATGGCTTATGCTGCTCTTCTTTCCCTCGCCCGAACCACTAGAGAAATAATCTTGGATCAAGATAGATATTCCATTTCTCGTAATAAAAAACAACAAATTCGATCTATCTATGAACCATTTATTTTCTTGCAAGAGTTTCTTGAAGATTTTCCCGAGAAAGCCAACATCTTGGATGGGCAAATCAGAGATTTAGCATATGAAGCAGAGCATATTATTGAGTCTTTCATATTGGTGGAAGCTCCGTCACATTGGTGGAATGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057801607.1
MAYAALLSLARTTREIILDQDRYSISRNKKQQIRSIYEPFIFLQEFLEDFPEKANILDGQIRDLAYEAEHIIESFILVEAPSHWWNVLAAKSKLKWQIRKIRKETKSITREVMIIKNNSAVAVQLGASSSAAAGSPSRSAPIIKIGYMVGLHEDLLTIKSRLCGESPNLEVIPIVGMGGIGKTTLAKCVYDDPLTVQRFDIRVWVTVSQDYNADVVLSALLASMEEFDKDRSKESNQLAGEKVFKILKGRRYLLVMDDIW...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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