当前解析结果
SmilChr03G000241| 统一新 Gene ID | SmilChr03G000241 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr03G000241 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr03G000241 |
| 染色体 / SeqID | Chr03 / NC_080389.1 |
| 坐标与链方向 | 2855374 - 2856807 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131016979 |
|---|---|
| GeneID | 131016979 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131016979 |
| 原始查询 | SmilChr03G000241 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131016979 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 0.60000 | XP_057801819.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.60000 | XP_057801819.1 |
| 3 | Cytosol | 细胞质基质 | 0.60000 | XP_057801819.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057801819.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057801819.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr3:2856140 |
C |
CT |
1bp_insertion | frameshift_variant | 1 | C64 |
Chr3:2856140 |
C |
CT |
1bp_insertion | CDS_variant | 1 | C64 |
Chr3:2856336 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B14,B72,B77,C21,C80 |
Chr3:2856347 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B18,B27,B81,B86,C30 |
Chr3:2856370 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B32,B64 |
Chr3:2856374 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B27,C30,C47,D7 |
Chr3:2856379 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | C47,C55,D7 |
Chr3:2856396 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B41,B53 |
Chr3:2856399 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B81,D10 |
Chr3:2856409 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B71,C25 |
Chr3:2856421 |
TC |
T |
1bp_deletion | frameshift_variant | 3 | A18,B104,C73 |
Chr3:2856421 |
TC |
T |
1bp_deletion | CDS_variant | 3 | A18,B104,C73 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。