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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G000251`

染色体: Chr03 坐标: 2963739-2974965 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G000251`
名称	SmilChr03G000251
描述	probable disease resistance RPP8-like protein 4
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	2963739 - 2974965 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131016930`
GeneID	`131016930`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131016930`
原始查询	`SmilChr03G000251`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable disease resistance RPP8-like protein 4
产物	probable disease resistance RPP8-like protein 4
Arabidopsis	`-` -
Rice	`-` -
GO	GO:0043531 (ADP binding); GO:0050832 (defense response to fungus)
KEGG	-
Pfam	PF00931 (NB-ARC); PF13401 (AAA_22)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131016930

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057801720.1`
2	Cell membrane	细胞膜	0.60000	`XP_057801718.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057801718.1`
4	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057801719.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057801718.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:2964334`	`GGA`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	3	A21,B59,B66
`Chr3:2964334`	`GGA`	`G`	2bp_deletion	CDS_variant	3	A21,B59,B66
`Chr3:2970587`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B10,B103,B45
`Chr3:2970609`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B125,B4
`Chr3:2970610`	`TGA`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	9	A19,B120,B55,B78,B79,C26,C50,D3,D4
`Chr3:2970619`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B75,B81,B92
`Chr3:2970643`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B125,B4,C53
`Chr3:2970660`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B99,C51
`Chr3:2970669`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C15,D8
`Chr3:2970672`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C1,C24
`Chr3:2970673`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C53,C56
`Chr3:2970674`	`TGG`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B103

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057801718.1

304 aa

152

304

NB-ARC

AAA_22

PF00931 NB-ARC 181-302 aa PF13401 AAA_22 193-283 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057801718.1`	Pfam	`PF00931`	NB-ARC	Domain	181	302	2.7e-29	102.7	NB-ARC domain
`XP_057801718.1`	Pfam	`PF13401`	AAA_22	Domain	193	283	1.3e-07	32.7	AAA domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA

XM_057945737.1
TTTAAAGACTTGAATAAGCGCATAGTTAAATGACGCCAATGACACATTGTTTGTGATAATAATTGAGGAGATATAGCCATTTTACACATTGTTTTTGCTGAAGCTATTCCATCAAATTCTTGTCCGAAATTCTCAGAAAAATATACACTGTTTTTCCTCGGATCATGGCGGCATATGCAGCCTCGGTTTCTCTTATGCATATCATCGATACAATCGAGCATCACCCTTCCCCTCCGATTTCTATAGACAAACAACAAGTT...

XM_057945736.1
TCATATATTCTTATTTTTAAAGACTTGAATAAGCGCATAGTTAAATGACGCCAATGACACATTGTTTGTGATAATAATTGAGGAGATATAGCCATTTTACACATTGTTTTTGCTGAAGCTATTCCATCAAATTCTTGTCCGAAATTCTCAGAAAAATATACACTGTTTTTCCTCGGATCATGGCGGCATATGCAGCCTCGGTTTCTCTTATGCATATCATCGATACAATCGAGCATCACCCTTCCCCTCCGATTTCTATA...

CDS

3 records

下载 CDS FASTA

LOC131016930
ATGGCGGCATATGCAGCCTCGGTTTCTCTTATGCATATCATCGATACAATCGAGCATCACCCTTCCCCTCCGATTTCTATAGACAAACAACAAGTTGAATCTCTCACTCAAATTGTTACCTTTTTGCAGGAATTTCTTGAAAGTTATAAGTCCCCTGTTGCTGACGGAGATGAAGCCGATCCGCTGGAGATGCGTATTGTAGATGCAGCTCATGCCGTTGAAGATGTTATCGAATCACATATTGTGAACGTGATTGAACT...

Protein

3 records

下载 Protein FASTA

XP_057801718.1
MAAYAASVSLMHIIDTIEHHPSPPISIDKQQVESLTQIVTFLQEFLESYKSPVADGDEADPLEMRIVDAAHAVEDVIESHIVNVIELGRSMSPNEEFLQGYVVDAAHAAEEVNSREEVSCIDFYQDLQQVIEEMNVIKKEAMETSAEAQPQRKVSSTHAGSLTSSSTVKESMMVGFDDVLLQLLDRLTGGNRNRQIIPITGMGGIGKTTLARHIFEHALVKEHFDIRAWTTISQTYNVRETLREVLHQVSGDSRSDLSEE...

XP_057801719.1
MAAYAASVSLMHIIDTIEHHPSPPISIDKQQVESLTQIVTFLQEFLESYKSPVADGDEADPLEMRIVDAAHAVEDVIESHIVNVIELGRSMSPNEEFLQGYVVDAAHAAEEVNSREEVSCIDFYQDLQQVIEEMNVIKKEAMETSAEAQPQRKVSSTHAGSLTSSSTVKESMMVGFDDVLLQLLDRLTGGNRNRQIIPITGMGGIAISCLVYQRRAFVSNKILLFSSRLHQLRSGSPHSLL

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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