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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G000290`

染色体: Chr03 坐标: 3300698-3303800 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G000290`
名称	SmilChr03G000290
描述	putative late blight resistance protein homolog R1A-10
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	3300698 - 3303800 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131016827`
GeneID	`131016827`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131016827`
原始查询	`SmilChr03G000290`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative late blight resistance protein homolog R1A-10
产物	putative late blight resistance protein homolog R1A-10
Arabidopsis	`AT1G58390` (AT1G58390) Disease resistance protein (CC-NBS-LRR class) family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842208] identity=25.8; qcov=0.973; evalue=1.35e-60; confidence=low
Rice	`Os07g0186500` - identity=28.2; qcov=0.821; evalue=1.15e-69; confidence=low
GO	GO:0043531 (ADP binding); GO:0098542 (defense response to other organism)
KEGG	-
Pfam	PF00931 (NB-ARC); PF23559 (WHD_DRP)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131016827

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	0.80000	`XP_057801569.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057801569.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057801569.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057801569.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057801569.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:3300940`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B138,B4,C2,C36,C81
`Chr3:3300941`	`TAG`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	16	A9,B118,B124,B22,B30,B45,B97,C1,C25,C26,C27,C33,C72,C76,D10,D3
`Chr3:3300959`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B138,B4,C2,C81
`Chr3:3300963`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A22,C36,C87
`Chr3:3300972`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A22,B71
`Chr3:3300974`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B129,B30,C63
`Chr3:3300982`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A2
`Chr3:3300984`	`CTG`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	8	A6,A9,B112,B81,B85,C22,C87,D10
`Chr3:3300986`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	49	A18,A20,A9,B118,B119,B120,B124,B127,B128,B22,B30,B31,B38,B39,B4,B45,B6,B63,B65,B67,B90,B97,C1,C11,C17,C25,C26,C27,C31,C33,C35,C42,C48,C5,C54,C56,C61,C68,C69,C7,C72,C74,C76,C79,C82,C86,D1,D3,D9
`Chr3:3300987`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	A24,B35
`Chr3:3300987`	`CA`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	2	A24,B35
`Chr3:3300992`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	8	A6,A9,B112,B81,B85,C22,C87,D10

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057801569.1

867 aa

434

867

NB-ARC

WHD_DRP

PF00931 NB-ARC 136-303 aa PF23559 WHD_DRP 390-461 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057801569.1`	Pfam	`PF00931`	NB-ARC	Domain	136	303	2.4e-43	148.4	NB-ARC domain
`XP_057801569.1`	Pfam	`PF23559`	WHD_DRP	Domain	390	461	2.8e-15	56.8	Disease resistance protein Winged helix domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057945586.1
ATATCTCCTCAATTATTATCAGAAACATTATGTGGCTACCTTTCTTCTACCTTCAGCTCTCACATTATTGCCAACTGGAGTTTCTCGAAGCTTATAACTCCTCTGTTTCCGACGAAGCAGATCCCTTGGAGATGCGTATTGCAGATGCAGCTTATGCAGCTGAAGACACCATCGAATCTCATATCGTGGCCAGGATTCAGCTGAGCAGATCCAGAGAAACCATTTGCAGCCGCTTCCGCAGCTGCTTTCGAGCTGAGGAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131016827
ATGTGGCTACCTTTCTTCTACCTTCAGCTCTCACATTATTGCCAACTGGAGTTTCTCGAAGCTTATAACTCCTCTGTTTCCGACGAAGCAGATCCCTTGGAGATGCGTATTGCAGATGCAGCTTATGCAGCTGAAGACACCATCGAATCTCATATCGTGGCCAGGATTCAGCTGAGCAGATCCAGAGAAACCATTTGCAGCCGCTTCCGCAGCTGCTTTCGAGCTGAGGAAGAGATGAACTTGTTTCAAGATGTGCAAAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057801569.1
MWLPFFYLQLSHYCQLEFLEAYNSSVSDEADPLEMRIADAAYAAEDTIESHIVARIQLSRSRETICSRFRSCFRAEEEMNLFQDVQNLIQEMDQIKSLAMQRNTEKVVLHDTRRSFVSASSSTGKNSSGMVVWSEGVVNGILERLVSDQRERQVIPITGMGGIGKTTLAKTVYSKKIVEQRFDVCAWATISQQYNTWEILCELVSQATKKTKEQLSEKSEDGLGLELHQYLSGRRFLIVMDDIWSIEAWDRIQRFFPENE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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