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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G000298`

染色体: Chr03 坐标: 3409304-3410734 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G000298`
名称	SmilChr03G000298
描述	putative late blight resistance protein homolog R1C-3
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	3409304 - 3410734 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131018102`
GeneID	`131018102`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131018102`
原始查询	`SmilChr03G000298`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative late blight resistance protein homolog R1C-3
产物	putative late blight resistance protein homolog R1C-3
Arabidopsis	`AT1G59780` (AT1G59780) NB-ARC domain-containing disease resistance protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842271] identity=22.8; qcov=1.07; evalue=1.95e-19; confidence=weak
Rice	`Os01g0547000` - identity=21.9; qcov=0.929; evalue=6.74e-20; confidence=weak
GO	GO:0006457 (protein folding); GO:0043014 (alpha-tubulin binding)
KEGG	-
Pfam	PF23559 (WHD_DRP)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131018102

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057802808.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057802808.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057802808.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057802808.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057802808.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:3409304`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	19	B108,B122,B137,B17,B65,B72,B73,B80,B85,C19,C20,C21,C23,C28,C32,C36,C6,C68,C81
`Chr3:3409305`	`TA`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	46	B109,B11,B111,B132,B134,B27,B37,B45,B47,B5,B59,B69,B70,B75,B77,B90,B92,C14,C15,C17,C2,C27,C29,C33,C37,C38,C41,C45,C46,C50,C56,C63,C64,C66,C69,C71,C75,C76,C79,C8,C82,D1,D3,D5,D6,D7
`Chr3:3409308`	`TA`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	65	B108,B109,B11,B111,B122,B132,B134,B137,B17,B27,B37,B45,B47,B5,B59,B65,B69,B70,B72,B73,B77,B80,B85,B90,B92,C14,C15,C17,C19,C2,C20,C21,C23,C27,C28,C29,C32,C33,C36,C37,C38,C41,C45,C46,C50,C56,C6,C63,C64,C66,C68,C69,C71,C75,C76,C79,C8,C81,C82,D1,D11,D3,D5,D6,D7
`Chr3:3409315`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	13	A5,B104,B3,B54,B57,B62,B7,B88,C34,C47,C5,C53,C86
`Chr3:3409316`	`T`	`TA`	1bp_insertion	frameshift_variant	61	B108,B109,B111,B122,B132,B134,B137,B17,B27,B37,B45,B47,B5,B59,B65,B69,B70,B72,B73,B77,B80,B85,C14,C15,C17,C19,C2,C20,C21,C23,C27,C28,C29,C32,C33,C36,C37,C38,C41,C45,C46,C50,C56,C6,C63,C64,C66,C68,C69,C71,C75,C76,C79,C8,C81,C82,D1,D11,D3,D5,D7
`Chr3:3409335`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B10,B45,B75,C25
`Chr3:3409340`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A23,B113,B127,B37,C51
`Chr3:3409348`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B108,C23
`Chr3:3409350`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A9,C18,C46
`Chr3:3409358`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr3:3409366`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B2,C64,D10
`Chr3:3409398`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C46

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057802808.1

476 aa

238

476

WHD_DRP

PF23559 WHD_DRP 3-74 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057802808.1`	Pfam	`PF23559`	WHD_DRP	Domain	3	74	2.1e-15	57.2	Disease resistance protein Winged helix domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057946825.1
ATGGGAGTGTTTGAGGAAGATGATTCGGTTAGAGTCTCTACACTCGTGAAGCTATGGGTTTCTGAAGGATTTTTAAAACCCATGAATGGGAAAAGTTTGGAAACTATTGCCATAGAGTTCTTAAAGGACTTGATTGATAGAAATCTCATTCTAGTTGATAAAGTGGGGTCTACAGGAAACATAAAATTTGTCAAAATTCATGATTTGTTGAGGGATTTATGCTTGAACCAGAGCAAGAAAGATGGGTTCTATCATGTCAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131018102
ATGGGAGTGTTTGAGGAAGATGATTCGGTTAGAGTCTCTACACTCGTGAAGCTATGGGTTTCTGAAGGATTTTTAAAACCCATGAATGGGAAAAGTTTGGAAACTATTGCCATAGAGTTCTTAAAGGACTTGATTGATAGAAATCTCATTCTAGTTGATAAAGTGGGGTCTACAGGAAACATAAAATTTGTCAAAATTCATGATTTGTTGAGGGATTTATGCTTGAACCAGAGCAAGAAAGATGGGTTCTATCATGTCAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057802808.1
MGVFEEDDSVRVSTLVKLWVSEGFLKPMNGKSLETIAIEFLKDLIDRNLILVDKVGSTGNIKFVKIHDLLRDLCLNQSKKDGFYHVIGQHAPRGISSLRRVVISRNAPMMEVLDDLQSMPRARSIISEYGRIPCIKYSRLLRTLHAYKFHYFGDESLIKSLASQYVNLRHLAVRVGSMSSIFTSFTRLWNLHILIVSCFEMFTAPADIWRMPQLRHIEMITGGRFYLPEPSSDDVVVMENLLVLVGIANFKCSEEVVKRI...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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