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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G000302`

染色体: Chr03 坐标: 3449974-3451236 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G000302`
名称	SmilChr03G000302
描述	putative late blight resistance protein homolog R1A-3
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	3449974 - 3451236 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131018105`
GeneID	`131018105`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131018105`
原始查询	`SmilChr03G000302`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative late blight resistance protein homolog R1A-3
产物	putative late blight resistance protein homolog R1A-3
Arabidopsis	`-` -
Rice	`-` -
GO	GO:0006457 (protein folding); GO:0043014 (alpha-tubulin binding)
KEGG	-
Pfam	PF23598 (LRR_14)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131018105

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057802811.1`
2	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057802811.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057802811.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057802811.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057802811.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:3449987`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B55,C85
`Chr3:3449996`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B115,B34,B38,B39,C1
`Chr3:3450029`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C33
`Chr3:3450039`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B128,B16,B70,C37,C38
`Chr3:3450046`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B2,B46,B78,C64,C70
`Chr3:3450069`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B74,C14
`Chr3:3450071`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B24,C14,C65
`Chr3:3450102`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B71
`Chr3:3450119`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B94
`Chr3:3450127`	`TCC`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	8	B100,B128,B16,B70,C15,C37,C38,D9
`Chr3:3450167`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	6	B101,B135,B23,C13,C2,C52
`Chr3:3450171`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B15

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057802811.1

382 aa

191

382

LRR_14

PF23598 LRR_14 21-356 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057802811.1`	Pfam	`PF23598`	LRR_14	Repeat	21	356	7.8e-14	51.9	Leucine-rich repeat region

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057946828.1
ATGAAGGAAGCAACACTTACAATATGTATTCCGAAGAAAGGGTATAGATCTGAGGGCGTTGTAGAGAAGTTTAACTCATTGAGGGTCCTTCAAGTTTTACGTAGAAACAATAATTGGGATTGGAAGCCAGGTCAAGTGTTCGATCTGGTTCATTTAACTTACCTTGCTTCCAACATTCCCAATAGTATTGTTCCTTCAGCTATATCAAAGCTTCAGAATCTTCAGACTTTAATTATTTATAGATCTGAGGAACTTTCGCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131018105
ATGAAGGAAGCAACACTTACAATATGTATTCCGAAGAAAGGGTATAGATCTGAGGGCGTTGTAGAGAAGTTTAACTCATTGAGGGTCCTTCAAGTTTTACGTAGAAACAATAATTGGGATTGGAAGCCAGGTCAAGTGTTCGATCTGGTTCATTTAACTTACCTTGCTTCCAACATTCCCAATAGTATTGTTCCTTCAGCTATATCAAAGCTTCAGAATCTTCAGACTTTAATTATTTATAGATCTGAGGAACTTTCGCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057802811.1
MKEATLTICIPKKGYRSEGVVEKFNSLRVLQVLRRNNNWDWKPGQVFDLVHLTYLASNIPNSIVPSAISKLQNLQTLIIYRSEELSLATDLVCNKRMVEMIPNIKKLGICYTKEKFDADAGYCLNNLKFFCLLEKLKLEKHDDFSCRQLDLLGSNMRGIFSSRQLDELGLEMRGGFSSRQLDELGFMMRGVSSSRQIDELELKMPGVFSSGQLDELRLEMRGDLSSRQFDEIGGLNFPLQLRRLTLSGWRLSWSHMKIIG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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