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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G000306`

染色体: Chr03 坐标: 3485868-3507753 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G000306`
名称	SmilChr03G000306
描述	sister chromatid cohesion 1 protein 4-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	3485868 - 3507753 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131016828`
GeneID	`131016828`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131016828`
原始查询	`SmilChr03G000306`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	sister chromatid cohesion 1 protein 4-like
产物	sister chromatid cohesion 1 protein 4-like
Arabidopsis	`AT5G16270` (SYN4) sister chromatid cohesion 1 protein 4 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831487] identity=62.4; qcov=0.328; evalue=1.29e-59; confidence=low
Rice	`Os01g0897800` (OsRad21) - identity=29.8; qcov=0.993; evalue=2.27e-42; confidence=low
GO	GO:0000795 (synaptonemal complex); GO:0003682 (chromatin binding); GO:0007064 (mitotic sister chromatid cohesion); GO:0007130 (synaptonemal complex assembly); GO:0008278 (cohesin complex); GO:1990414 (replication-born double-strand break repair via sister chromatid exchange)
KEGG	-
Pfam	PF04824 (Rad21_Rec8)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131016828

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057801571.1`
2	Chromosome	染色体	0.80000	`XP_057801571.1`
3	Nucleoplasm	核质	0.60000	`XP_057801572.1`
4	Nuclear body	核内小体	0.40000	`XP_057801572.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057801571.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:3486040`	`TCA`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	C31
`Chr3:3486040`	`TCA`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	1	C31
`Chr3:3486041`	`CAG`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	99	A1,A14,A19,A20,A22,A23,A24,A25,A4,A6,B101,B104,B107,B109,B11,B110,B111,B113,B115,B117,B118,B120,B121,B124,B127,B128,B130,B132,B138,B140,B20,B21,B22,B24,B26,B27,B29,B30,B42,B48,B49,B52,B58,B62,B63,B65,B7,B71,B72,B76,B8,B83,B85,B87,B89,B95,C10,C13,C17,C18,C2,C22,C23,C24,C25,C26,C27,C3,C30,C33,C34,C35,C39,C41,C42,C45,C46,C47,C5,C51,C55,C57,C59,C6,C60,C63,C69,C7,C70,C74,C76,C78,C8,C81,C85,C87,D2,D3,D5
`Chr3:3486071`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	17	B106,B137,B16,B57,B69,B97,B98,C15,C23,C38,C40,C56,C77,C79,C82,D2,D8
`Chr3:3486087`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	5	B103,B28,B32,C45,C73
`Chr3:3486087`	`C`	`CT`	1bp_insertion	CDS_variant	5	B103,B28,B32,C45,C73
`Chr3:3486101`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A16,B21,B87,C35,C80
`Chr3:3486600`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	A3
`Chr3:3486600`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A3
`Chr3:3486638`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B119,B64,C54,C85,D1
`Chr3:3497329`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A22,B101,B140,C27
`Chr3:3497331`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B6,C16

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057801571.1

590 aa

295

590

Rad21_Rec8

PF04824 Rad21_Rec8 534-583 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057801571.1`	Pfam	`PF04824`	Rad21_Rec8	Family	534	583	1.3e-17	63.6	Conserved region of Rad21 / Rec8 like protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

9 records

下载 cDNA FASTA

XR_009099225.1
GACATTCCTATTGAATTGGAAGACATTGGGTTCAAAATTGCTAAAAACTGTGGAGGATTGCCCCTTTCAATCGTGGTGGCAGCAGGACTTCTATCTAAGATTCCGATTCATACTCGATCTTCATGGAAGAAAATTGCTGCAGACGGTGGGCAACTTGAAACAATAATTTGTTTAAGTTATACTCATTTACCTAATCACTTGAAGCGGTGTCTTTTATATATGGCTGGCTTTCCAGAAGATCAGGAGATTCGTGTTACAGA...

XR_009099226.1
GACATTCCTATTGAATTGGAAGACATTGGGTTCAAAATTGCTAAAAACTGTGGAGGATTGCCCCTTTCAATCGTGGTGGCAGCAGGACTTCTATCTAAGATTCCGATTCATACTCGATCTTCATGGAAGAAAATTGCTGCAGACGGTGGGCAACTTGAAACAATAATTTGTTTAAGTTATACTCATTTACCTAATCACTTGAAGCGGTGTCTTTTATATATGGCTGGCTTTCCAGAAGATCAGGAGATTCGTGTTACAGA...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131016828
ATGATGATGGAAGTTAGCCCTGGGGACTTTGAGGGTCTTGATGAAGGTGACACCGGGAGCAAAACTGCTGCGGGCAGAAAGCGTACTTTTACTGAAAGTACACTAACGGAACAAAGTCTCAATTCAGTTGAATCTTCAAGAGAAGTCCGCATCAAAAGAACGACGGGATCAGTTCCGGATGATGATGATTTACTGTCTTCTATTTTAGTTGGAAGGAAATCATCAATTTTGAGAGTAAAGCCAACACCTCCTCCTTCTGA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057801571.1
MMMEVSPGDFEGLDEGDTGSKTAAGRKRTFTESTLTEQSLNSVESSREVRIKRTTGSVPDDDDLLSSILVGRKSSILRVKPTPPPSEVTSMKRHRTAPRSGAPKRKVLMDDTMVLHGDAIRQQLTNAGDIRRVRKKAPCTLSEISMIRKQHMGDETFLEPVFTGMSVELASLHSCVYDLGRIKVCQNEVHDACLQTVIELGQPSQNDDNGNLPETVVEFHPTSPAIRSHDMDDHEGPGKTNAIEVGGQDLNNEFLTVREN...

XP_057801572.1
MMMEVSPGDFEGLDEGDTGSKTAAGRKRTFTESTLTEQSLNSVESSREVRIKRTTGSVPDDDDLLSSILVGRKSSILRVKPTPPPSEVTSMKRHRTAPRSGAPKRKVLMDDTMVLHGDAIRQQLTNAGDIRRVRKKAPCTLSEISMIRKQHMGDETFLEPVFTGMSVELASLHSCVYDLGRIKVCQNEVHDACLQTVIELGQPSQNDDNGNLPETVVEFHPTSPAIRSHDMDDHEGPGKTNAIEVGGQDLNNEFLTVREN...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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