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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G000328`

染色体: Chr03 坐标: 3738629-3740052 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G000328`
名称	SmilChr03G000328
描述	replication protein A 70 kDa DNA-binding subunit D-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	3738629 - 3740052 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131018113`
GeneID	`131018113`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131018113`
原始查询	`SmilChr03G000328`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	replication protein A 70 kDa DNA-binding subunit D-like
产物	replication protein A 70 kDa DNA-binding subunit D-like
Arabidopsis	`AT5G61000` (RPA70D) Replication factor-A protein 1-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836221] identity=30; qcov=0.407; evalue=8.29e-08; confidence=low
Rice	`Os03g0214100` (OsRPA1) - identity=25.3; qcov=0.617; evalue=2.32e-10; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF08646 (Rep_fac-A_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131018113

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057802819.1`
2	Chromosome	染色体	0.80000	`XP_057802819.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057802819.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057802819.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057802819.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:3738844`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C38,C44,C69
`Chr3:3738845`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B55,B88,B96
`Chr3:3738881`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B47,C58
`Chr3:3738890`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B12,B46,B54
`Chr3:3738896`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B120,B67,C59,C85
`Chr3:3738949`	`T`	`TG`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	A24
`Chr3:3738949`	`T`	`TG`	1bp_insertion	CDS_variant	1	A24
`Chr3:3738962`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B139,B90,C12,C24
`Chr3:3738971`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B51,C30,C81,D5
`Chr3:3738972`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B85
`Chr3:3738982`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B10,B103,B106,B12,B82
`Chr3:3738986`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B111,B55,C84

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057802819.1

295 aa

148

295

Rep_fac-A_C

PF08646 Rep_fac-A_C 66-200 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057802819.1`	Pfam	`PF08646`	Rep_fac-A_C	Domain	66	200	5.9e-11	43.1	Replication factor-A C terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057946836.1
ATGAGATCCGTCTTGCAAATTACACCAACATGCAAAGAGATCCAGCTGATCCAATCGTGTTCTGATGTTGATGATGATGCATTAGCAATTGCTAAATTAGCAATGGCACAAAAAATAAAACAAGCAAAGCAAGTCACTCTTAAAGATCTCAGAGACAATCAACATTTATTATCAGAGGGTGTTTCGTATTGTTTTACGGGAATTATCGACAAAGTTGAAAATAAAGCAACAATATGGTATGATTCTTGTAAAAATTGCAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131018113
ATGAGATCCGTCTTGCAAATTACACCAACATGCAAAGAGATCCAGCTGATCCAATCGTGTTCTGATGTTGATGATGATGCATTAGCAATTGCTAAATTAGCAATGGCACAAAAAATAAAACAAGCAAAGCAAGTCACTCTTAAAGATCTCAGAGACAATCAACATTTATTATCAGAGGGTGTTTCGTATTGTTTTACGGGAATTATCGACAAAGTTGAAAATAAAGCAACAATATGGTATGATTCTTGTAAAAATTGCAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057802819.1
MRSVLQITPTCKEIQLIQSCSDVDDDALAIAKLAMAQKIKQAKQVTLKDLRDNQHLLSEGVSYCFTGIIDKVENKATIWYDSCKNCNTSFSKIDESAICKKCNEEVLETSPRYRITINVIQGDCNARITLFGQVAEVYVGCSVDEYLSSIKEGETESTYYRRLSTQAYTEMRFMTMLKSIKFDQRGNLNIVANAIEKMEPMESIDVGDIEEEPTEVEEKKHSPEKSKNKIPSRKKKSTMELQPTESQKKKRRITKKKFHD...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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