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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G000330`

染色体: Chr03 坐标: 3743835-3747100 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G000330`
名称	SmilChr03G000330
描述	putative late blight resistance protein homolog R1B-17
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	3743835 - 3747100 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131016880`
GeneID	`131016880`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131016880`
原始查询	`SmilChr03G000330`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative late blight resistance protein homolog R1B-17
产物	putative late blight resistance protein homolog R1B-17
Arabidopsis	`AT1G59620` (CW9) Disease resistance protein (CC-NBS-LRR class) family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842252] identity=36; qcov=0.487; evalue=5.31e-32; confidence=medium
Rice	`Os11g0633500` - identity=36.7; qcov=0.496; evalue=2.54e-41; confidence=medium
GO	GO:0043531 (ADP binding); GO:0098542 (defense response to other organism)
KEGG	-
Pfam	PF00931 (NB-ARC)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131016880

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	0.60000	`XP_057801645.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057801645.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057801645.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057801645.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057801645.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:3745642`	`A`	`AC`	1bp_insertion	frameshift_variant	7	B28,B57,B92,C27,C42,C5,C67
`Chr3:3745661`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A11,B134,B55,B67
`Chr3:3745686`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A22,B48
`Chr3:3745687`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A11
`Chr3:3745711`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A20,C4,C43,D10,D6
`Chr3:3745736`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A22,B48
`Chr3:3745753`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C52
`Chr3:3745760`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C25,C42,C71
`Chr3:3745787`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A9
`Chr3:3745843`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B22,B72
`Chr3:3745952`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	9	A13,B47,B52,B97,B98,C19,C33,C56,C77
`Chr3:3746009`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A13,B10,C11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057801645.1

456 aa

228

456

NB-ARC

PF00931 NB-ARC 252-414 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057801645.1`	Pfam	`PF00931`	NB-ARC	Domain	252	414	8.2e-39	133.7	NB-ARC domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057945662.1
CTTTCTCTGAAAAATATACACTGTTTTTCCTTGGATCATGGCAGCCTATGCAGCCATAGTTTCTCTTATGAATACCATCAATCAGATCGAGCACCACCCTTCCCCTCCAATTTCTATCCACAAACAACAACTTGAATCTCTCACTCAAATTCTTACCTTTTTGCAGGAATTTCTTGAAAGTTATAAGTCCCCTGTTGCCGATGGAGATGAAGCTGATCCGCTGGAGATGCGTATCGCAGATGCAGCTCATGCTGTTGAAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131016880
ATGGCAGCCTATGCAGCCATAGTTTCTCTTATGAATACCATCAATCAGATCGAGCACCACCCTTCCCCTCCAATTTCTATCCACAAACAACAACTTGAATCTCTCACTCAAATTCTTACCTTTTTGCAGGAATTTCTTGAAAGTTATAAGTCCCCTGTTGCCGATGGAGATGAAGCTGATCCGCTGGAGATGCGTATCGCAGATGCAGCTCATGCTGTTGAAGATGTTATCGAATCACATATTGTGGACAAGCTTCAGCC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057801645.1
MAAYAAIVSLMNTINQIEHHPSPPISIHKQQLESLTQILTFLQEFLESYKSPVADGDEADPLEMRIADAAHAVEDVIESHIVDKLQPRRSKRIADAAYAAEDAIESHIVDKLHLRRSKKAKIDTAEADEQINFYQDRLQQVIEEMNVIKKEAMENELGRSMSPNQEFLQGYVVDAAHAAEEVNSREEVSCIDFYQDLQQVIEEMNVIKKEAMETSAEAQLQRKVSSTHAGSLTCSSTAKESKMVGFDDVQLQLLDWLTGG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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