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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G000331`

染色体: Chr03 坐标: 3752101-3754476 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G000331`
名称	SmilChr03G000331
描述	uncharacterized SmilChr03G000331
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	3752101 - 3754476 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131016975`
GeneID	`131016975`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131016975`
原始查询	`SmilChr03G000331`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Ribosomal protein S5 family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842796]; symbol=AT1G64880; hit=AT1G64880; species=arabidopsis; confidence=high
产物	Ribosomal protein S5 family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842796]; symbol=AT1G64880; hit=AT1G64880; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT1G64880` (AT1G64880) Ribosomal protein S5 family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842796] identity=76.7; qcov=1; evalue=4.42e-71; confidence=high
Rice	`Os02g0102400` - identity=71.6; qcov=1.01; evalue=1.68e-67; confidence=high
GO	GO:0003723 (RNA binding); GO:0003735 (structural constituent of ribosome); GO:0005840 (ribosome); GO:0006412 (translation)
KEGG	-
Pfam	PF00333 (Ribosomal_S5); PF03719 (Ribosomal_S5_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131016975

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057801814.1`
2	Nucleolus	核仁	0.40000	`XP_057801814.1`
3	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057801814.1`
4	Mitochondrion	线粒体	0.20000	`XP_057801814.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057801814.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:3752444`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	10	A10,A16,A24,B63,B74,B95,B96,C18,C44,D5
`Chr3:3752454`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B37,C48,C7,C8
`Chr3:3752482`	`C`	`CTA`	2bp_insertion	frameshift_variant	31	A13,A7,A8,B100,B101,B106,B109,B110,B115,B124,B125,B128,B131,B136,B16,B30,B33,B39,B40,B43,B45,B48,B62,B7,B76,B80,B90,C12,C3,C55,D4
`Chr3:3752495`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr3:3752505`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	6	A16,A22,B14,C34,C58,C78
`Chr3:3752772`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A3,B27,C80
`Chr3:3752812`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B22,B66,B77,C26
`Chr3:3752968`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B111
`Chr3:3752982`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C30,C8,D9
`Chr3:3752994`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B102,B139
`Chr3:3753295`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	11	A11,B35,B39,B75,B86,B9,C13,C15,C25,C73,C78
`Chr3:3753297`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A8,B30,B37

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057801814.1

133 aa

133

Ribosomal_S5

Ribosomal_S5_C

PF00333 Ribosomal_S5 2-40 aa PF03719 Ribosomal_S5_C 55-122 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057801814.1`	Pfam	`PF00333`	Ribosomal_S5	Domain	2	40	5.2e-10	39.9	Ribosomal protein S5, N-terminal domain
`XP_057801814.1`	Pfam	`PF03719`	Ribosomal_S5_C	Domain	55	122	2.3e-22	78.9	Ribosomal protein S5, C-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057945831.1
GATAATAAATGCCTTGGCTATTTACGACCTGCACATAATCATATGATGATATTCTTCACATTTGATCTAATATTTACCATTTTTCTTTTCTATTCATGAATCATGGGAACTATTGTTTCTGGTAGTCATTTATGTACCATCAGATCAATATGTTAAATTGGGTGTCTCCATTGTGTGCAGGGTTTTGATGTTAGGCTGGTCGATGTGAATAGGACGTGTAAAGTTACAAAGGGTGGACAAGTTATCAAATACACTGCAAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131016975
ATGTTAGCTTGTGGGAACTACAATGGTGTTATTGGTTTTGCTAAAGCAAAGGCTCCTGCAGTTCCGCTTGCTCTTCAAAAGGCATATGAGAAGTGCTTTCAGAATCTGCACTATGTAGAGCGGCATGAGGATCATACAATTGCACATGCAATTCAGACATCGTATAAAAAGACTAAGGTGTATCTTTGGCCAGCTCCTACACAATCAGGGATGAAGGCAGGCAAAACTGTGGAGTTGATTCTTAACTTAGCTGGTTACAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057801814.1
MLACGNYNGVIGFAKAKAPAVPLALQKAYEKCFQNLHYVERHEDHTIAHAIQTSYKKTKVYLWPAPTQSGMKAGKTVELILNLAGYRNVKSKVVGSRNPHNTVKALFKALNAIETPKDVQEKFGRTVVESYLL

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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