当前解析结果
SmilChr03G000333| 统一新 Gene ID | SmilChr03G000333 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr03G000333 |
| 描述 | epimerase family protein SDR39U1 homolog, chloroplastic-like |
| 染色体 / SeqID | Chr03 / NC_080389.1 |
| 坐标与链方向 | 3777501 - 3780755 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131016984 |
|---|---|
| GeneID | 131016984 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131016984 |
| 原始查询 | SmilChr03G000333 |
| 来源 | GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | epimerase family protein SDR39U1 homolog, chloroplastic-like |
| 产物 | epimerase family protein SDR39U1 homolog%2C chloroplastic-like |
| Arabidopsis | AT2G21280 (SULA)NAD(P)-binding Rossmann-fold superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:816667] identity=65.8; qcov=1.11; evalue=1.62e-42; confidence=medium |
| Rice | Os02g0834700 (P0264G11.15-1)- identity=59.6; qcov=1.11; evalue=3.63e-39; confidence=medium |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | PF01370 (Epimerase) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131016984 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasm | 细胞质 | 1.00000 | XP_057801826.1 |
| 2 | Peroxisome | 过氧化物酶体 | 0.20000 | XP_057801825.1 |
| 3 | Nucleus | 细胞核 | 0.20000 | XP_057801826.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057801826.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057801826.1 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057801825.1PF01370
Epimerase 4-85 aa
XP_057801826.1PF01370
Epimerase 4-85 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057801825.1 |
Pfam | PF01370 |
Epimerase | Family | 4 | 85 | 6.6e-07 | 29.7 | NAD dependent epimerase/dehydratase family |
XP_057801826.1 |
Pfam | PF01370 |
Epimerase | Family | 4 | 85 | 6.8e-07 | 29.7 | NAD dependent epimerase/dehydratase family |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
4 records
下载 cDNA FASTA2 records
下载 CDS FASTA2 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。