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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G000343`

染色体: Chr03 坐标: 3883590-3885464 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G000343`
名称	SmilChr03G000343
描述	putative late blight resistance protein homolog R1B-16
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	3883590 - 3885464 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131018120`
GeneID	`131018120`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131018120`
原始查询	`SmilChr03G000343`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative late blight resistance protein homolog R1B-16
产物	putative late blight resistance protein homolog R1B-16
Arabidopsis	`AT3G46530` (RPP13) NB-ARC domain-containing disease resistance protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:823806] identity=31.6; qcov=0.938; evalue=5.78e-59; confidence=low
Rice	`Os07g0186500` - identity=29.5; qcov=1; evalue=2.15e-56; confidence=low
GO	GO:0043531 (ADP binding); GO:0098542 (defense response to other organism)
KEGG	-
Pfam	PF00931 (NB-ARC); PF23559 (WHD_DRP); PF23598 (LRR_14)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131018120

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057802825.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057802825.1`
3	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057802825.1`
4	Cell membrane	细胞膜	0.20000	`XP_057802825.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057802825.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:3884169`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B54
`Chr3:3884187`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B60,C48
`Chr3:3884225`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C46
`Chr3:3884293`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B100
`Chr3:3884293`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B100
`Chr3:3884300`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B30,B87,C42,D6
`Chr3:3884305`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B30,C42,D6
`Chr3:3884319`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B102,B117,B137,C26
`Chr3:3884359`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C14,C55,C80
`Chr3:3884366`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A9,C10
`Chr3:3884506`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C41
`Chr3:3884518`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B20

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057802825.1

624 aa

312

624

NB-ARC

WHD_DRP

LRR_14

PF00931 NB-ARC 17-101 aa PF23559 WHD_DRP 178-248 aa PF23598 LRR_14 305-504 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057802825.1`	Pfam	`PF00931`	NB-ARC	Domain	17	101	1.1e-22	81.2	NB-ARC domain
`XP_057802825.1`	Pfam	`PF23559`	WHD_DRP	Domain	178	248	3.6e-19	69.3	Disease resistance protein Winged helix domain
`XP_057802825.1`	Pfam	`PF23598`	LRR_14	Repeat	305	504	3.1e-22	79.5	Leucine-rich repeat region

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057946842.1
ATGAAAGGAAAGGGAATCCAAGCAGAGAGTGATTTACAATGCAAGGTTAAGGAGTCTGAAATATACAAATACTTAAAAGGTAGGAGGTATCTCATAGTAGTGGACGACATTTGGGGTATGGAAGCTTGGGATCACATACAGAGGCTATTACCTGATGATAATAATGGAAGCCGAATCATATTAACCACAAGGCTAAAGAATGTAGCTGCTTATGCTAACTCTGCGAGCCCCATTCATATGTTGCGTTTCTTGGATGACCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131018120
ATGAAAGGAAAGGGAATCCAAGCAGAGAGTGATTTACAATGCAAGGTTAAGGAGTCTGAAATATACAAATACTTAAAAGGTAGGAGGTATCTCATAGTAGTGGACGACATTTGGGGTATGGAAGCTTGGGATCACATACAGAGGCTATTACCTGATGATAATAATGGAAGCCGAATCATATTAACCACAAGGCTAAAGAATGTAGCTGCTTATGCTAACTCTGCGAGCCCCATTCATATGTTGCGTTTCTTGGATGACCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057802825.1
MKGKGIQAESDLQCKVKESEIYKYLKGRRYLIVVDDIWGMEAWDHIQRLLPDDNNGSRIILTTRLKNVAAYANSASPIHMLRFLDDQQSWHLFQKKVVGDQDCPVELQEIGEKYVKRCEGLPLSIVTVAGLLSKIDRTPKLWKRIGANDGQLETILLSLSYKHLPRHLRECFLYMAGFPEDYEIRVSELIKLWVAEGFLEGRDESKTLEEVAEDVLEVLVEQSLVLVTSKKSDGKIKRCKLHSVVRDFCSRQAGEEKFLL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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