当前解析结果
SmilChr03G000349| 统一新 Gene ID | SmilChr03G000349 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr03G000349 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr03G000349 |
| 染色体 / SeqID | Chr03 / NC_080389.1 |
| 坐标与链方向 | 3919408 - 3920790 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131018123 |
|---|---|
| GeneID | 131018123 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131018123 |
| 原始查询 | SmilChr03G000349 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131018123 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasm | 细胞质 | 1.00000 | XP_057802828.1 |
| 2 | Nucleus | 细胞核 | 0.80000 | XP_057802828.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057802828.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057802828.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057802828.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr3:3919431 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B63,B83 |
Chr3:3919434 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B69,C1 |
Chr3:3919457 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C1 |
Chr3:3919458 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B83,C49,C86 |
Chr3:3919465 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B83,C59 |
Chr3:3919485 |
CA |
C |
1bp_deletion | frameshift_variant | 69 | A11,A15,A19,A2,A20,A8,A9,B107,B109,B11,B111,B119,B121,B125,B126,B129,B134,B137,B138,B140,B16,B18,B22,B3,B31,B37,B39,B60,B62,B65,B69,B71,B82,B85,B90,B95,B96,B99,C1,C11,C14,C16,C18,C20,C21,C25,C29,C31,C32,C36,C38,C41,C42,C43,C51,C53,C54,C56,C58,C59,C60,C63,C68,C74,C77,C78,C82,C84,D11 |
Chr3:3919498 |
TG |
T |
1bp_deletion | frameshift_variant | 30 | A13,A15,A2,A22,A23,A3,B10,B109,B11,B114,B125,B13,B2,B21,B55,B65,B81,B85,B94,C11,C16,C2,C28,C3,C31,C35,C46,C51,C68,C85 |
Chr3:3919509 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 1 | B24 |
Chr3:3919509 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B24 |
Chr3:3919531 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B25,C66 |
Chr3:3919535 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C31 |
Chr3:3919543 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B78,C31,C69 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。