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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G000358`

染色体: Chr03 坐标: 4018307-4019446 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G000358`
名称	SmilChr03G000358
描述	probable disease resistance protein At1g59620
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	4018307 - 4019446 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131018126`
GeneID	`131018126`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131018126`
原始查询	`SmilChr03G000358`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable disease resistance protein At1g59620
产物	probable disease resistance protein At1g59620
Arabidopsis	`AT1G59780` (AT1G59780) NB-ARC domain-containing disease resistance protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842271] identity=36.9; qcov=0.504; evalue=4.69e-13; confidence=low
Rice	`Os11g0229300` - identity=25.5; qcov=0.616; evalue=8.62e-08; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF23598 (LRR_14)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131018126

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057802831.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057802831.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057802831.1`
4	Cell membrane	细胞膜	0.20000	`XP_057802831.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057802831.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:4018372`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C48
`Chr3:4018520`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A15
`Chr3:4018531`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B101,B67,C68
`Chr3:4018533`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B108,C23
`Chr3:4018549`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B121,B20,B76,C48
`Chr3:4018570`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B135,C48
`Chr3:4018573`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B71
`Chr3:4018573`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B71
`Chr3:4018587`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A23,C31
`Chr3:4018647`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C53,C86
`Chr3:4018650`	`A`	`AC`	1bp_insertion	frameshift_variant	8	A1,A8,B100,B7,B85,C63,C64,C66
`Chr3:4018658`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A1,A8,B100,B101

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057802831.1

242 aa

121

242

LRR_14

PF23598 LRR_14 51-215 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057802831.1`	Pfam	`PF23598`	LRR_14	Repeat	51	215	1.2e-11	44.7	Leucine-rich repeat region

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057946848.1
ATGGGTTTATTCAAAGAGGATCAAAATATAGATGTTGAGGATCTATATCTGATGTGGATAGCACAAGGCATGATTTCATATGAGAATATTCGAGACAAGGACACAACTTTGATGGAAGTCGCGGCGCTCTACTTGGGAAGAAAGTTACCGAAAGGAATCACTAATCTTGTTCACCTTAGACGTTTGGCTTTACGAAGATGTCAATTTGATAAGCTACCATCGTCCATAAGGAATTTGGTATACATGGATACCCTTGATTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131018126
ATGGGTTTATTCAAAGAGGATCAAAATATAGATGTTGAGGATCTATATCTGATGTGGATAGCACAAGGCATGATTTCATATGAGAATATTCGAGACAAGGACACAACTTTGATGGAAGTCGCGGCGCTCTACTTGGGAAGAAAGTTACCGAAAGGAATCACTAATCTTGTTCACCTTAGACGTTTGGCTTTACGAAGATGTCAATTTGATAAGCTACCATCGTCCATAAGGAATTTGGTATACATGGATACCCTTGATTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057802831.1
MGLFKEDQNIDVEDLYLMWIAQGMISYENIRDKDTTLMEVAALYLGRKLPKGITNLVHLRRLALRRCQFDKLPSSIRNLVYMDTLDLCGSMNVGVPNVFKEMLRIKHLSFPYYDKEKIGNFRVRLDVGVAELESLIEFNSKVHESKCVDRMKNLRHFEAHIYDNESLSAIIDAIVIMDKLVFCWVEISMGCELGTNERVLEKAFTCPNLHELWINVKLGKALPECGSDFMIAILLEKILLEI

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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