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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G000365`

染色体: Chr03 坐标: 4083602-4084786 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G000365`
名称	SmilChr03G000365
描述	uncharacterized SmilChr03G000365
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	4083602 - 4084786 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131016949`
GeneID	`131016949`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131016949`
原始查询	`SmilChr03G000365`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	confidence=no_hit
产物	confidence=no_hit
Arabidopsis	`-` -
Rice	`-` -
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF00646 (F-box); PF07734 (FBA_1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131016949

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057801764.1`
2	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057801764.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057801764.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057801764.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057801764.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:4083769`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr3:4083920`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B22
`Chr3:4083953`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A10,B22
`Chr3:4083956`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A10,B22
`Chr3:4083977`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A23,B114,B70
`Chr3:4084033`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B109,B37,B82
`Chr3:4084073`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	34	A1,A14,A25,A4,B104,B107,B121,B122,B129,B130,B18,B2,B27,B32,B44,B51,B54,B58,B64,B67,B81,B85,B86,B9,C12,C17,C24,C29,C37,C4,C42,C46,C50,D11
`Chr3:4084092`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B52,C37,C54
`Chr3:4084204`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B111,B113,C5,C75
`Chr3:4084206`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B38,B80,C62
`Chr3:4084237`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D6
`Chr3:4084249`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A5,B47,C45

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057801764.1

221 aa

110

221

F-box

FBA_1

PF00646 F-box 10-33 aa PF07734 FBA_1 41-165 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057801764.1`	Pfam	`PF00646`	F-box	Domain	10	33	0.00036	21.1	F-box domain
`XP_057801764.1`	Pfam	`PF07734`	FBA_1	Repeat	41	165	6.9e-09	35.9	F-box associated beta propeller domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057945781.1
CACGATTAGAAACATTACTACTTCAAATTACAAAACCCTCTCTTTATCTTTGTAACCGCCGCCGCAGATGGATAGCAAAAACACCAAACAATCTCTGCATCTTCCCGAAGAAATCATCGAAGAAATACTGTCAAGACTTGCGGTGAAATCGCTCTTGAAATTCAGAATCTCGAGGATATTGCCTGAGACGCCTGGTTACAAGCATTGGTTTTATGGATTCGGCTGCGATGAGTCGAGTGGTGATTACAAGGTTATTGCTA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131016949
ATGGATAGCAAAAACACCAAACAATCTCTGCATCTTCCCGAAGAAATCATCGAAGAAATACTGTCAAGACTTGCGGTGAAATCGCTCTTGAAATTCAGAATCTCGAGGATATTGCCTGAGACGCCTGGTTACAAGCATTGGTTTTATGGATTCGGCTGCGATGAGTCGAGTGGTGATTACAAGGTTATTGCTAGTGCTGATGAACCATTTGAGCGTAAAAATAATATAGCTAAAGTATATAGCTTGAAGACTGATTCGTG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057801764.1
MDSKNTKQSLHLPEEIIEEILSRLAVKSLLKFRISRILPETPGYKHWFYGFGCDESSGDYKVIASADEPFERKNNIAKVYSLKTDSWKETTGPWELFMTFRAEQRGMLASGKLHWEIISYGIVSFDLKEEVFEIVEESFEEEHFDCAITTLAESGIDQLSLMNVQCLFIDVCRESAEVSACEGLQLIKYSTYDYGIHLRGWEFTEAAYYDCRIYVESLVSP

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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