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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G000377`

染色体: Chr03 坐标: 4206521-4207305 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G000377`
名称	SmilChr03G000377
描述	F-box/kelch-repeat protein At3g23880-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	4206521 - 4207305 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131018139`
GeneID	`131018139`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131018139`
原始查询	`SmilChr03G000377`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	F-box/kelch-repeat protein At3g23880-like
产物	F-box/kelch-repeat protein At3g23880-like
Arabidopsis	`AT3G23880` (AT3G23880) F-box and associated interaction domains-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821971] identity=24; qcov=1.18; evalue=5.42e-11; confidence=weak
Rice	`Os09g0447600` - identity=32.4; qcov=0.614; evalue=2.07e-08; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF07734 (FBA_1); PF08268 (FBA_3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131018139

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057802842.1`
2	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057802842.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057802842.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057802842.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057802842.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:4206562`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr3:4206617`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A13,A25,B11,B124,B73
`Chr3:4206800`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A18
`Chr3:4206918`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B47
`Chr3:4206987`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	11	B60,B65,B7,B76,B77,C19,C21,C22,C23,C48,C61
`Chr3:4207025`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C15
`Chr3:4207042`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	15	B102,B29,B34,B36,B67,B72,B86,B94,C29,C36,C4,C46,C65,C80,D6
`Chr3:4207182`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B102,B34,B72
`Chr3:4207227`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B59
`Chr3:4207234`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B34,B67,C36,C80

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057802842.1

236 aa

118

236

FBA_3

FBA_1

PF08268 FBA_3 3-140 aa PF07734 FBA_1 3-153 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057802842.1`	Pfam	`PF08268`	FBA_3	Repeat	3	140	2.7e-13	50.3	F-box associated beta propeller domain
`XP_057802842.1`	Pfam	`PF07734`	FBA_1	Repeat	3	153	9.6e-17	61.7	F-box associated beta propeller domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057946859.1
ATGGGGAGCTGTAATGGGTTGCTCTGCATTCATGAGAAACCAAGTATTGGGGAACAAAGTAGATTTCACTTGTGGAACCCATCCACTAGAATCTCCAAGAAACTGCCACAAATTTCTAATTGCGGCTATGTTACAGCTGTGGGGTTCGGTTGGGTTGAATCCAGTGATGAGTACAAGGTGTTTGTGAGTTTTGGTAATTTAGATTATGATACGCGGCAGACAAAATCAGTTTGTAAAGTTTATAGTTCAAAGACAAAATC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131018139
ATGGGGAGCTGTAATGGGTTGCTCTGCATTCATGAGAAACCAAGTATTGGGGAACAAAGTAGATTTCACTTGTGGAACCCATCCACTAGAATCTCCAAGAAACTGCCACAAATTTCTAATTGCGGCTATGTTACAGCTGTGGGGTTCGGTTGGGTTGAATCCAGTGATGAGTACAAGGTGTTTGTGAGTTTTGGTAATTTAGATTATGATACGCGGCAGACAAAATCAGTTTGTAAAGTTTATAGTTCAAAGACAAAATC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057802842.1
MGSCNGLLCIHEKPSIGEQSRFHLWNPSTRISKKLPQISNCGYVTAVGFGWVESSDEYKVFVSFGNLDYDTRQTKSVCKVYSSKTKSWKTIEHCAYLYSCGVAGIFAGGKLYWKNEHEKVITFLDIKSEVFGRIEIPLGQEKEVIRVWVMKEEAWKRVATFANLVELLQPAPLVVGPKGEILVNFGSILLVYEILVNFGSILLVYDRQDNVFRCPMVNFLYSPRVYVESLVSPEDV

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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