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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G000378`

染色体: Chr03 坐标: 4229780-4233095 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G000378`
名称	SmilChr03G000378
描述	putative late blight resistance protein homolog R1B-23
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	4229780 - 4233095 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131016839`
GeneID	`131016839`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131016839`
原始查询	`SmilChr03G000378`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative late blight resistance protein homolog R1B-23
产物	putative late blight resistance protein homolog R1B-23
Arabidopsis	`AT1G53350` (AT1G53350) Disease resistance protein (CC-NBS-LRR class) family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841771] identity=26.1; qcov=1.11; evalue=7.19e-68; confidence=low
Rice	`Os06g0146100` (Pi9(t)) - identity=25.2; qcov=1.13; evalue=1.12e-57; confidence=low
GO	GO:0043531 (ADP binding); GO:0098542 (defense response to other organism)
KEGG	-
Pfam	PF00931 (NB-ARC); PF18052 (Rx_N); PF23559 (WHD_DRP); PF23598 (LRR_14)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131016839

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057801591.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057801591.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057801591.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057801591.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057801591.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:4229873`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B26,C40
`Chr3:4229959`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A2,B2,B41,C10,C74
`Chr3:4229973`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C56,C81,D6
`Chr3:4230003`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D6
`Chr3:4230025`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B140,C2,C20
`Chr3:4230126`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A5,B47,C45
`Chr3:4230870`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B21,B22,B71,B84,C84
`Chr3:4230887`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B131,B6,C25
`Chr3:4230908`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A18
`Chr3:4230925`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B71
`Chr3:4230967`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B37,C77,C8
`Chr3:4231021`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A4,B127,B5,B57

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057801591.1

805 aa

402

805

Rx_N

NB-ARC

WHD_DRP

LRR_14

PF18052 Rx_N 9-79 aa PF00931 NB-ARC 138-288 aa PF23559 WHD_DRP 342-410 aa PF23598 LRR_14 465-763 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057801591.1`	Pfam	`PF18052`	Rx_N	Domain	9	79	1.6e-10	41.6	Rx N-terminal domain
`XP_057801591.1`	Pfam	`PF00931`	NB-ARC	Domain	138	288	1.5e-37	129.5	NB-ARC domain
`XP_057801591.1`	Pfam	`PF23559`	WHD_DRP	Domain	342	410	7.1e-18	65.1	Disease resistance protein Winged helix domain
`XP_057801591.1`	Pfam	`PF23598`	LRR_14	Repeat	465	763	1e-14	54.8	Leucine-rich repeat region

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057945608.1
GAGATGGCGGAGGCTGCAGTGGAATTTTTGTTGGAGCAAGTGAAGGACGCGTTGAAGCAGTTGAAGAGCGACCTGGCTTTACTCAAGGGTTTCCTCAAGCAGATGGCGGAGAAGAAGCAAAAGGAAGATCCGTTGATTTTACTGGAGAGGCAGATGAGGGATGCGGTTTACATGGCGGAGGACACCATAGACACATGCTCGATCAACGCTATCGCCAACAAATCCATCCACAAGAATGTCAGACTCGCCAAGGAGGTGAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131016839
ATGGCGGAGGCTGCAGTGGAATTTTTGTTGGAGCAAGTGAAGGACGCGTTGAAGCAGTTGAAGAGCGACCTGGCTTTACTCAAGGGTTTCCTCAAGCAGATGGCGGAGAAGAAGCAAAAGGAAGATCCGTTGATTTTACTGGAGAGGCAGATGAGGGATGCGGTTTACATGGCGGAGGACACCATAGACACATGCTCGATCAACGCTATCGCCAACAAATCCATCCACAAGAATGTCAGACTCGCCAAGGAGGTGAAATC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057801591.1
MAEAAVEFLLEQVKDALKQLKSDLALLKGFLKQMAEKKQKEDPLILLERQMRDAVYMAEDTIDTCSINAIANKSIHKNVRLAKEVKSIREDRIKPLLDKFATLDFKSGGVQDSLADSKGRDTPIRQNKVVGFDKEEATITGYLKEKTDKLDVISIVGMPGLGKTTLARKIYQSNEIGYHFPIRIWVNISQVFDNRDVFLQILKKFFPSRDTSSLNLNDLVQTVRACLKKEKFLLVLDDVWSVVAWNQIKEVLPVDSAEGK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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