当前解析结果
SmilChr03G000379| 统一新 Gene ID | SmilChr03G000379 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr03G000379 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr03G000379 |
| 染色体 / SeqID | Chr03 / NC_080389.1 |
| 坐标与链方向 | 4234526 - 4237623 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131016955 |
|---|---|
| GeneID | 131016955 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131016955 |
| 原始查询 | SmilChr03G000379 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131016955 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057801780.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 1.00000 | XP_057801780.1 |
| 3 | Nucleoplasm | 核质 | 0.20000 | XP_057801780.1 |
| 4 | Cytosol | 细胞质基质 | 0.20000 | XP_057801780.1 |
| 5 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057801780.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr3:4236148 |
T |
TA |
1bp_insertion | frameshift_variant | 72 | A1,A14,A20,A21,A25,A3,A4,A6,A7,B103,B104,B108,B111,B112,B115,B121,B126,B133,B135,B17,B20,B22,B23,B27,B28,B40,B46,B50,B52,B58,B6,B60,B64,B65,B76,B79,B9,B98,B99,C11,C17,C18,C19,C2,C20,C21,C23,C24,C26,C29,C32,C33,C37,C39,C42,C44,C48,C54,C58,C6,C60,C61,C63,C64,C66,C67,C68,C69,C78,C85,D2,D9 |
Chr3:4236204 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B75 |
Chr3:4236460 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B111 |
Chr3:4236464 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C59 |
Chr3:4236465 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B23 |
Chr3:4236476 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A23,B114,B131,B70,D11 |
Chr3:4236552 |
TC |
T |
1bp_deletion | frameshift_variant | 6 | A18,B3,B44,C47,C53,C86 |
Chr3:4236636 |
CA |
* |
1bp_deletion | CDS_variant | 3 | B29,C43,C5 |
Chr3:4236758 |
GC |
G |
1bp_deletion | frameshift_variant | 2 | A9,B113 |
Chr3:4236758 |
GC |
G |
1bp_deletion | CDS_variant | 2 | A9,B113 |
Chr3:4236789 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B109,B127,B133,B5,B57 |
Chr3:4236810 |
AAC |
A |
2bp_deletion | frameshift_variant | 4 | A9,B113,B63,B83 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
4 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。