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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G000380`

染色体: Chr03 坐标: 4255692-4259229 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G000380`
名称	SmilChr03G000380
描述	putative late blight resistance protein homolog R1A-4
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	4255692 - 4259229 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131016884`
GeneID	`131016884`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131016884`
原始查询	`SmilChr03G000380`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative late blight resistance protein homolog R1A-4
产物	putative late blight resistance protein homolog R1A-4
Arabidopsis	`AT1G59620` (CW9) Disease resistance protein (CC-NBS-LRR class) family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842252] identity=35.9; qcov=0.658; evalue=5.29e-49; confidence=medium
Rice	`Os11g0633500` - identity=37.2; qcov=0.653; evalue=2.69e-57; confidence=medium
GO	GO:0043531 (ADP binding); GO:0098542 (defense response to other organism)
KEGG	-
Pfam	PF00931 (NB-ARC)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131016884

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	0.80000	`XP_057801651.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057801651.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057801651.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057801651.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057801651.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:4255961`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B122,B44
`Chr3:4256021`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A3,B61,C14,C15,C72
`Chr3:4256098`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B43
`Chr3:4256116`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B64
`Chr3:4256127`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D6
`Chr3:4256131`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B102
`Chr3:4256420`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B123
`Chr3:4256420`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B123
`Chr3:4256476`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B36
`Chr3:4256516`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D6
`Chr3:4256569`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B105,B56,C16,D4
`Chr3:4256595`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B67

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057801651.1

453 aa

226

453

NB-ARC

PF00931 NB-ARC 183-344 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057801651.1`	Pfam	`PF00931`	NB-ARC	Domain	183	344	4.9e-40	137.6	NB-ARC domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057945668.1
TCTTATTTAAACACTTGAATCAGCGCATACATAAATGACTTCAAGAAAAGCACATGGTTTCTTCAATTAATTAATTACACAGAATACAGTGCTTTGGAGAGGATCGATACATCCATTATCATGTGCATAGCCATTTTACACATTGTTTCTGATAATAATTGAGGAGAGGAGATATAGCCATTTTACACATTGTTTTTGCTGAACCTAAACTAAGATTCCATCAAATTCTTTCTCAGAAAAATATACACTCGTTTTCCTTG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131016884
ATGGCGGCATATGCAGCCATAGTTTCTGTTATACATATCATCGATACAATCGAGCATCACCATTCCCCTCCAATTTGTATCGACAAACAACAACTTGAATCTCTCACTCGAATTGTTACCTCTTTGCAGGAATTTCTTGAAGGTTATAAGTCCCTTGTTGCTGACGGAGATGAAGCTGATCCGCTGGAGATGCGTATTGTAGATGCAGCTCATGCTGTTGAAGATGTTATCGAATCACATATTGTGGATGTGATTAAACT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057801651.1
MAAYAAIVSVIHIIDTIEHHHSPPICIDKQQLESLTRIVTSLQEFLEGYKSLVADGDEADPLEMRIVDAAHAVEDVIESHIVDVIKLGRSSPNPNEIFLQGYVVDAVHAAEEVNSGEEVSCIDFYEDLQQVIEEMNVIKKEAMEIAAETQLQRKVSSTHAGSLTSSSNVKEGMMVGFDDVQLQLLDWLTGGNRNRQILPITGMGGIGKTTLARHIFEHALVKEHFDICAWTTISQTYNIRETLGQVLKQVTGNLGSDDLS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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