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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G000384`

染色体: Chr03 坐标: 4280929-4282725 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G000384`
名称	SmilChr03G000384
描述	transcription initiation factor TFIID subunit 4b-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	4280929 - 4282725 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131016957`
GeneID	`131016957`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131016957`
原始查询	`SmilChr03G000384`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	transcription initiation factor TFIID subunit 4b-like
产物	transcription initiation factor TFIID subunit 4b-like
Arabidopsis	`AT5G43130` (TAF4) TBP-associated factor 4 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834330] identity=50.3; qcov=0.947; evalue=3.32e-37; confidence=medium
Rice	`Os02g0654400` - identity=44.8; qcov=1.02; evalue=5.2e-39; confidence=medium
GO	GO:0003677 (DNA binding); GO:0005669 (transcription factor TFIID complex); GO:0006367 (transcription initiation at RNA polymerase II promoter); GO:0016251 (RNA polymerase II general transcription initiation factor activity)
KEGG	-
Pfam	PF05236 (TAF4)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131016957

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057801782.1`
2	Nucleoplasm	核质	0.60000	`XP_057801782.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057801782.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057801782.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057801782.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:4281248`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B30
`Chr3:4281346`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C13,C58
`Chr3:4281350`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr3:4282036`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B8,C60
`Chr3:4282119`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C37,C74

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057801782.1

189 aa

189

TAF4

PF05236 TAF4 2-178 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057801782.1`	Pfam	`PF05236`	TAF4	Family	2	178	9.4e-25	88.6	Transcription initiation factor TFIID component TAF4 family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057945799.1
CAGACTTTCAAAACAGCGAGTGGATGTGGAAAAGCCAAGGCACAAGACCATTATCACTTCCGATGTTCGACAACAGATTATGGCCATAAATTCCAAAGCTCGTGAAGATTGGGAGAAAAAGCAGGCTGAAACTGAAAAGTCCCAGAAGGTGAGTGAATCTGAAAGCAGTACAGGAGCTGATGCTGATAAGGAGAAGGATGAAAATCGTGGAAAATTAGTGAAGGTTAACAAAGAGGAAGATGATAAAATGCGTGCGACAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131016957
ATGGCCATAAATTCCAAAGCTCGTGAAGATTGGGAGAAAAAGCAGGCTGAAACTGAAAAGTCCCAGAAGGTGAGTGAATCTGAAAGCAGTACAGGAGCTGATGCTGATAAGGAGAAGGATGAAAATCGTGGAAAATTAGTGAAGGTTAACAAAGAGGAAGATGATAAAATGCGTGCGACAGCTGCAAATGTTGCTGTTCGAGCTGCTACTGGAGTGGGTGATATTACATCAAGATGGCAATTAATGATCGAGGCCAACCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057801782.1
MAINSKAREDWEKKQAETEKSQKVSESESSTGADADKEKDENRGKLVKVNKEEDDKMRATAANVAVRAATGVGDITSRWQLMIEANQKQGGTDISSGPQTNKDVGRKPLATSTRNTRENQESEKRDSSVALTTPASIRKVGRNQVVVPRLARSISVKDVIALLEREPQMSKSTLLYRLYHKVSADAVSE

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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