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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G000386`

染色体: Chr03 坐标: 4291465-4292439 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G000386`
名称	SmilChr03G000386
描述	uncharacterized SmilChr03G000386
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	4291465 - 4292439 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131016937`
GeneID	`131016937`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131016937`
原始查询	`SmilChr03G000386`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os07g0255200; species=rice; confidence=medium
产物	hit=Os07g0255200; species=rice; confidence=medium
Arabidopsis	`AT5G28780` (AT5G28780) PIF1 helicase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832993] identity=37.3; qcov=0.961; evalue=2.24e-48; confidence=medium
Rice	`Os07g0255200` - identity=43.9; qcov=0.759; evalue=1.58e-62; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF21530 (Pif1_2B_dom)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131016937

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057801731.1`
2	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057801731.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057801731.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057801731.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057801731.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:4291597`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B107,B64,C23,C54
`Chr3:4291624`	`TTG`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	2	B64,C54
`Chr3:4291624`	`TTG`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	2	B64,C54
`Chr3:4291632`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B134
`Chr3:4291664`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A13,B134,B55
`Chr3:4291723`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B55
`Chr3:4291754`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A5,B104,C46
`Chr3:4291776`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B65
`Chr3:4291785`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A5,B104,C46
`Chr3:4291847`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B62
`Chr3:4291915`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	3	A5,C46,D7
`Chr3:4291915`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A5,C46,D7

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057801731.1

282 aa

141

282

Pif1_2B_dom

PF21530 Pif1_2B_dom 115-161 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057801731.1`	Pfam	`PF21530`	Pif1_2B_dom	Domain	115	161	3.9e-18	65.6	DNA helicase Pif1, 2B domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057945748.1
CTTGGTGGAGATTTTCGGCAAACTATACCAATTGTTCGAAGGGGTTCTCGTGAAGAGATAGTGGATGCTTGTTTGGTATATTCATCCATATGGCTTCTTATTCGAAAAATTCATTTGACACAGAATATGCGGGCAATGGAGGATCTTGTTTTTACAGATTTGTTATTGAGGGTTGGTGAAGGCATAGAGCCAAATGTTCGTGCTGATTATATTAATCTTCCTGAAGATATGTGCCTTTCTTACCATGGTTCAGATTCGCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131016937
ATGCGGGCAATGGAGGATCTTGTTTTTACAGATTTGTTATTGAGGGTTGGTGAAGGCATAGAGCCAAATGTTCGTGCTGATTATATTAATCTTCCTGAAGATATGTGCCTTTCTTACCATGGTTCAGATTCGCCTCTTGACACACTGGTTAATGAAATATTTCCGTCGTTTGATGCATATTCTAGCGGTTCTTCGAGCCTTATAAATACCGCTATTTTAACTCCTAAAAATGAATGCATGGGAGAAATTAATGAATCATT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057801731.1
MRAMEDLVFTDLLLRVGEGIEPNVRADYINLPEDMCLSYHGSDSPLDTLVNEIFPSFDAYSSGSSSLINTAILTPKNECMGEINESLIGKFPGNMVEYVSTDYANDPSQQQYYQDYMNAISVGSLPPHVLKLKVNCPVMLLRNLNPLEGLCNGTRLIVHDLGRHVIGAVIAVGTHSGEYVLIPRIPLELDDTHICPITFKRLQFPLRLCFAISINKSQGQTLDRVGVYLSHPVFSHGQVYVALSRVRTSSSIKFLIRPPV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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