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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G000414`

染色体: Chr03 坐标: 4455027-4457909 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G000414`
名称	SmilChr03G000414
描述	putative late blight resistance protein homolog R1B-17
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	4455027 - 4457909 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131018159`
GeneID	`131018159`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131018159`
原始查询	`SmilChr03G000414`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative late blight resistance protein homolog R1B-17
产物	putative late blight resistance protein homolog R1B-17
Arabidopsis	`AT1G50180` (AT1G50180) NB-ARC domain-containing disease resistance protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841440] identity=36.1; qcov=0.645; evalue=5.9e-52; confidence=medium
Rice	`Os11g0633500` - identity=33.4; qcov=0.702; evalue=1.55e-54; confidence=low
GO	GO:0043531 (ADP binding); GO:0098542 (defense response to other organism)
KEGG	-
Pfam	PF00931 (NB-ARC); PF23559 (WHD_DRP)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131018159

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	0.80000	`XP_057802858.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057802858.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057802858.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057802858.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057802858.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:4455083`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	6	B64,B73,B97,C24,C42,C86
`Chr3:4455175`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B14,B22,B63,B83,D4
`Chr3:4455261`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	31	A4,A5,A7,B102,B107,B119,B121,B122,B124,B127,B139,B22,B26,B37,B46,B5,B55,B62,B63,B7,B75,B82,B85,B92,B94,C29,C43,C44,C62,C8,D4
`Chr3:4455266`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B78
`Chr3:4455281`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B78
`Chr3:4455329`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C10
`Chr3:4455397`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B112,B52,C10,C23,C55
`Chr3:4455417`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A9,C62,C71
`Chr3:4455533`	`A`	`AG`	1bp_insertion	frameshift_variant	27	A11,A16,A2,B122,B124,B134,B139,B14,B17,B24,B40,B46,B47,B8,B88,B90,B99,C15,C18,C19,C25,C32,C34,C4,C47,C56,C86
`Chr3:4455534`	`TAA`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	27	A11,A16,A2,B122,B124,B134,B139,B14,B17,B24,B40,B46,B47,B8,B88,B90,B99,C15,C18,C19,C25,C32,C34,C4,C47,C56,C86
`Chr3:4455537`	`T`	`TC`	1bp_insertion	stop_gained,frameshift_variant	26	A11,A16,A2,B122,B124,B134,B139,B14,B17,B24,B40,B46,B47,B8,B90,B99,C15,C18,C19,C25,C32,C34,C4,C47,C56,C86
`Chr3:4455545`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C64,C66

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057802858.1

507 aa

254

507

NB-ARC

WHD_DRP

PF00931 NB-ARC 197-365 aa PF23559 WHD_DRP 445-488 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057802858.1`	Pfam	`PF00931`	NB-ARC	Domain	197	365	5.2e-38	131.0	NB-ARC domain
`XP_057802858.1`	Pfam	`PF23559`	WHD_DRP	Domain	445	488	3.8e-13	50.0	Disease resistance protein Winged helix domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057946875.1
ATGGCGGCATATGCAGCCTTGGTTTCTCTTATGCATATCATCGATACAATCGAGCATCACCATTCCCCTCCAGTTTCTATCGACAAACAACAAGTTGAATCTCTAATTGTTACCTTTTCGCAGAAATTTCTTGAAGGTTATAAGTCCCCTGTTGCTGACGGAGATGAAGCAGATCCATTGGAGATGTGTATTGTAGATGCAGCTCATGCGGTTGTAGATGTTCTCGAATCACATATTGTGAACGTGATTGAACTGGAGTA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131018159
ATGGCGGCATATGCAGCCTTGGTTTCTCTTATGCATATCATCGATACAATCGAGCATCACCATTCCCCTCCAGTTTCTATCGACAAACAACAAGTTGAATCTCTAATTGTTACCTTTTCGCAGAAATTTCTTGAAGGTTATAAGTCCCCTGTTGCTGACGGAGATGAAGCAGATCCATTGGAGATGTGTATTGTAGATGCAGCTCATGCGGTTGTAGATGTTCTCGAATCACATATTGTGAACGTGATTGAACTGGAGTA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057802858.1
MAAYAALVSLMHIIDTIEHHHSPPVSIDKQQVESLIVTFSQKFLEGYKSPVADGDEADPLEMCIVDAAHAVVDVLESHIVNVIELEYHDFLPSTTTTLVNQEFMRSLAHQVVHLKSLLEGFPYLHNGLKRKIYTTEDVMEYILSLKTPPEESNSERKRRLRRAEKLKSIVGLSDTSTAVGSSSRRELTSKDDVVGIQRDLSKIKEQLTRPSLGLKVLPIVGMGGIGKTTLAKLVYSDKLIMEHFQIRGWVTISQDYSVTS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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