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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G000431`

染色体: Chr03 坐标: 4668593-4669177 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G000431`
名称	SmilChr03G000431
描述	putative disease resistance RPP13-like protein 3
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	4668593 - 4669177 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131018165`
GeneID	`131018165`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131018165`
原始查询	`SmilChr03G000431`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative disease resistance RPP13-like protein 3
产物	putative disease resistance RPP13-like protein 3
Arabidopsis	`AT3G46730` (AT3G46730) NB-ARC domain-containing disease resistance protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:823826] identity=30.5; qcov=1.03; evalue=7.23e-17; confidence=low
Rice	`Os11g0604900` - identity=33.7; qcov=0.948; evalue=1.08e-18; confidence=low
GO	GO:0098542 (defense response to other organism)
KEGG	-
Pfam	PF23559 (WHD_DRP)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131018165

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057802865.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057802865.1`
3	Endoplasmic reticulum	内质网	0.20000	`XP_057802865.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057802865.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057802865.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:4668600`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C19
`Chr3:4668601`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A14,B46,B62
`Chr3:4668610`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B74
`Chr3:4668614`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	54	A20,B100,B101,B102,B106,B120,B129,B130,B132,B134,B137,B16,B27,B28,B36,B42,B43,B51,B52,B54,B62,B66,B69,B70,B79,B81,B82,B87,B93,B97,B99,C10,C15,C23,C25,C38,C50,C52,C55,C56,C61,C65,C7,C70,C75,C77,C79,C8,C82,C83,C9,D5,D7,D9
`Chr3:4668621`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A9,B20,B73,C18,C2
`Chr3:4668677`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	4	A8,B7,C39,C64
`Chr3:4668677`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A8,B7,C39,C64
`Chr3:4668685`	`A`	`AAT`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	C19
`Chr3:4668685`	`A`	`AAT`	2bp_insertion	CDS_variant	1	C19
`Chr3:4668744`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B55,C14
`Chr3:4668767`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B107,B35,B50,B9
`Chr3:4668773`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A8,B35,B7,B85

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057802865.1

194 aa

194

WHD_DRP

PF23559 WHD_DRP 4-74 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057802865.1`	Pfam	`PF23559`	WHD_DRP	Domain	4	74	3.5e-21	75.7	Disease resistance protein Winged helix domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057946882.1
ATGGCTGGCTTTCCAGAAGATTATGAGATTCGTGTCTCAGAACTTATTCACCTTTGGATAGCTGAGGGTATTGTAACACTTTCAAATGGATCAAAAAGATTGGAAGAGGAGGCAGAAGATTGTTTCGATGATCTTGTCGAGAGAAGTCTAGTTCTGGTCATCAACAGGAAGTCTAATGGGAAAATAAAGAGTTGCAGCATTCATGATATTGTGCGAGAATTTCTGGTAAGGCAGGCTGCAAAAGAGAAGGTAATTCTTTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131018165
ATGGCTGGCTTTCCAGAAGATTATGAGATTCGTGTCTCAGAACTTATTCACCTTTGGATAGCTGAGGGTATTGTAACACTTTCAAATGGATCAAAAAGATTGGAAGAGGAGGCAGAAGATTGTTTCGATGATCTTGTCGAGAGAAGTCTAGTTCTGGTCATCAACAGGAAGTCTAATGGGAAAATAAAGAGTTGCAGCATTCATGATATTGTGCGAGAATTTCTGGTAAGGCAGGCTGCAAAAGAGAAGGTAATTCTTTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057802865.1
MAGFPEDYEIRVSELIHLWIAEGIVTLSNGSKRLEEEAEDCFDDLVERSLVLVINRKSNGKIKSCSIHDIVREFLVRQAAKEKVILSVMDYLPTPILRSHFVPHLIKDHHSICANSYDLHLKDYVHSSDIHTIICIPKKGYRSVGSVEKFSSLKVLHVLRRSNYWDWEPGQVFDLIHLTYIASNIPNSIVPSAI

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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