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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G000444`

染色体: Chr03 坐标: 4760496-4764034 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G000444`
名称	SmilChr03G000444
描述	protein IQ-DOMAIN 3-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	4760496 - 4764034 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131017126`
GeneID	`131017126`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131017126`
原始查询	`SmilChr03G000444`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein IQ-DOMAIN 3-like
产物	protein IQ-DOMAIN 3-like
Arabidopsis	`AT3G52290` (IQD3) IQ-domain 3 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824394] identity=49.9; qcov=0.994; evalue=2.29e-112; confidence=high
Rice	`Os05g0123200` - identity=46; qcov=1.07; evalue=1.07e-110; confidence=high
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF00612 (IQ)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131017126

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoskeleton	细胞骨架	1.00000	`XP_057801841.1`
2	Cell membrane	细胞膜	0.60000	`XP_057801841.1`
3	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057801841.1`
4	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057801841.1`
5	Nucleus membrane	核膜	0.20000	`XP_057801841.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:4760936`	`G`	`GTT`	2bp_insertion	frameshift_variant	8	B32,B48,C28,C30,C4,C41,C54,C60
`Chr3:4760955`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B48,C45,D10,D5
`Chr3:4760975`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C30
`Chr3:4760995`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C14
`Chr3:4761054`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A21,B66
`Chr3:4761075`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	D10,D11
`Chr3:4761092`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C85
`Chr3:4761105`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B111,B50,B87
`Chr3:4761333`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D8
`Chr3:4762006`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A19,B32,B76,C43,C49
`Chr3:4762031`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	74	A1,A16,A2,A24,A4,A7,A8,B1,B100,B105,B109,B112,B124,B131,B138,B18,B20,B22,B29,B31,B35,B38,B39,B4,B40,B41,B42,B52,B53,B57,B60,B64,B65,B7,B72,B73,B78,B85,B88,B9,B90,B91,B98,C1,C10,C2,C21,C23,C29,C3,C30,C34,C35,C40,C41,C45,C48,C49,C50,C52,C54,C56,C58,C60,C61,C62,C63,C66,C70,C71,C8,C85,D8,D9
`Chr3:4762390`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B130,B69

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057801841.1

462 aa

231

462

PF00612 IQ 116-134 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057801841.1`	Pfam	`PF00612`	IQ	Motif	116	134	5.4e-08	32.7	IQ calmodulin-binding motif

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057945858.1
TACACTTCCTTAATTATCAGATTAAGATTTCATTCTCTCTCTCTACTCTCTCTCATAAACACACACATCTCCGCTTACACATGACAGTACTCGAGCCACCTTGGTGAGATTCACCGCTTATTTGTAGATAAACCAGTAGCAGAAGACGAAGACGTCGAAGAAGAAGACGAATTACATGTTTGCATAATCACGAATCGCCTTTGAAATTCACAAGAGCAGATCTTTCACTGACGGTAAAAAAAATGGGAAAGAAAATGGGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131017126
ATGGGAAAGAAAATGGGATGGCTTCACGCAGTGAAGAAAGCAATGAGCTGCGGATCAGGGCAGAGTAGTAGAAAGAAGAATCGAAAATCGGGAGACTGGGGGAAGGAGGTGCTATATTTGGATTCGTACAATGCAGAAAACGCAGCAGTGGTCCCTGCTTCTCAATCTCCGGTGGGGGAGGCGAAGCTGATGGAAGCCGAGAATGAACAGAGCAGGCATGCTTATTCTGTTGCTCTTGCGACTGCTGCAGCTGCTGAGGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057801841.1
MGKKMGWLHAVKKAMSCGSGQSSRKKNRKSGDWGKEVLYLDSYNAENAAVVPASQSPVGEAKLMEAENEQSRHAYSVALATAAAAEAAVAAAHAAAEVVRLTAAARGSGKTKEEIAAIKIQAAFRGHLARRALKALRGHARLRSLIEGQSVKRQATSTLKYMQLLGRMQSEVRARRTRKSEENLSIQHQIQQKHEREQLEKFRASIGEDWDDSMQSKEQIEANLQHRQEAAIRRERALAYAYTHQQTWRASSNSANQTFM...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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