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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G000456`

染色体: Chr03 坐标: 4860679-4863481 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G000456`
名称	SmilChr03G000456
描述	cytosolic sulfotransferase 5-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	4860679 - 4863481 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131018172`
GeneID	`131018172`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131018172`
原始查询	`SmilChr03G000456`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	cytosolic sulfotransferase 5-like
产物	cytosolic sulfotransferase 5-like
Arabidopsis	`AT3G45070` (AT3G45070) P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:823642] identity=49.8; qcov=0.978; evalue=1.56e-113; confidence=high
Rice	`Os04g0526300` - identity=46.2; qcov=0.994; evalue=1.11e-95; confidence=high
GO	GO:0005737 (cytoplasm); GO:0008146 (sulfotransferase activity); GO:0051923 (sulfation)
KEGG	-
Pfam	PF00685 (Sulfotransfer_1); PF13469 (Sulfotransfer_3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131018172

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057802874.1`
2	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057802874.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057802874.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057802874.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057802874.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:4860717`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B41
`Chr3:4860736`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C8
`Chr3:4860761`	`G`	`GAA`	2bp_insertion	frameshift_variant	51	A10,A13,A2,A22,A25,B100,B101,B102,B107,B114,B115,B117,B123,B124,B137,B14,B24,B34,B35,B39,B41,B42,B47,B59,B61,B65,B66,B67,B7,B70,B84,B88,B94,B95,C15,C18,C19,C22,C28,C32,C38,C45,C48,C56,C59,C67,C74,C75,C79,C87,D6
`Chr3:4860765`	`CG`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	54	A10,A13,A2,A22,A25,B100,B101,B102,B107,B114,B115,B117,B123,B124,B137,B14,B24,B34,B35,B39,B41,B42,B47,B59,B61,B65,B66,B67,B7,B70,B84,B88,B94,B95,C15,C18,C19,C22,C28,C32,C38,C45,C48,C56,C59,C62,C63,C67,C74,C75,C79,C87,D4,D6
`Chr3:4860827`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C30
`Chr3:4860846`	`T`	`TA`	1bp_insertion	frameshift_variant	3	B17,B26,C78
`Chr3:4860846`	`T`	`TA`	1bp_insertion	CDS_variant	3	B17,B26,C78
`Chr3:4860849`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B17,B26,C78
`Chr3:4860899`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B69
`Chr3:4862851`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B110,B35,D11
`Chr3:4862857`	`CGA`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	12	A22,A3,B123,B140,B17,B18,B6,B77,B94,C22,C74,D7
`Chr3:4862860`	`A`	`AGC`	2bp_insertion	frameshift_variant	10	A22,B123,B140,B17,B18,B6,B77,C22,C74,D7

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057802874.1

322 aa

161

322

Sulfotransfer_1

Sulfotransfer_3

PF00685 Sulfotransfer_1 61-319 aa PF13469 Sulfotransfer_3 152-244 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057802874.1`	Pfam	`PF00685`	Sulfotransfer_1	Domain	61	319	7.6e-75	252.3	Sulfotransferase domain
`XP_057802874.1`	Pfam	`PF13469`	Sulfotransfer_3	Domain	152	244	3.5e-09	37.9	Sulfotransferase family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057946891.1
ATGTCATCTTCAAATTCCTTCCAATGGCCACAACTATCCCAAGACTTCAAAGAGTTCCTCTCCACTCTACCTAGAGAAAAAGGATTCGCAAAAGAACCTCTCTACCTCTATCAAGGTTTCTGGTACGAGGACGTCTTTCTCGAAGGTGCAATTTCAAGCCAAGAACATTTCCAAGCGGAGGATTCTGACGTCTTCGTCGCCTCCACCCCGAAATGCGGCACCACGTGGCTGAAGGCGATCGCGTTCGCTCTACTGAACCG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131018172
ATGTCATCTTCAAATTCCTTCCAATGGCCACAACTATCCCAAGACTTCAAAGAGTTCCTCTCCACTCTACCTAGAGAAAAAGGATTCGCAAAAGAACCTCTCTACCTCTATCAAGGTTTCTGGTACGAGGACGTCTTTCTCGAAGGTGCAATTTCAAGCCAAGAACATTTCCAAGCGGAGGATTCTGACGTCTTCGTCGCCTCCACCCCGAAATGCGGCACCACGTGGCTGAAGGCGATCGCGTTCGCTCTACTGAACCG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057802874.1
MSSSNSFQWPQLSQDFKEFLSTLPREKGFAKEPLYLYQGFWYEDVFLEGAISSQEHFQAEDSDVFVASTPKCGTTWLKAIAFALLNRRRNQAPDHPLLSNNPHDLVPYLEMDLYGENKALDIALFPSPRLLATHMPYSSLPKLIRSSGTKCKILYVARNPKDTLVSMRHFYTRVRMLDLMWAESFKLLCEGLSGYGPFWDHILGYWKQSLENPDRVLFLKYEDMKARPAAEVRRVAEFLGCPFSAEEVEAGEVDRILELC...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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