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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G000458`

染色体: Chr03 坐标: 4885451-4887397 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G000458`
名称	SmilChr03G000458
描述	cytosolic sulfotransferase 5-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	4885451 - 4887397 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131017139`
GeneID	`131017139`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131017139`
原始查询	`SmilChr03G000458`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	cytosolic sulfotransferase 5-like
产物	cytosolic sulfotransferase 5-like
Arabidopsis	`AT3G45070` (AT3G45070) P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:823642] identity=51.6; qcov=0.916; evalue=1.69e-116; confidence=high
Rice	`Os04g0526300` - identity=47.6; qcov=0.925; evalue=1.09e-96; confidence=high
GO	GO:0005737 (cytoplasm); GO:0008146 (sulfotransferase activity); GO:0051923 (sulfation)
KEGG	-
Pfam	PF00685 (Sulfotransfer_1); PF13469 (Sulfotransfer_3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131017139

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057801858.1`
2	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057801858.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057801858.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057801858.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057801858.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:4886183`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B119,B27,B83
`Chr3:4886196`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B119,B27,B83
`Chr3:4886201`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	3	B119,B27,B83
`Chr3:4886201`	`C`	`CA`	1bp_insertion	CDS_variant	3	B119,B27,B83
`Chr3:4886244`	`TTA`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	2	A5,C20
`Chr3:4886244`	`TTA`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	2	A5,C20
`Chr3:4886245`	`T`	`TC`	1bp_insertion	frameshift_variant	7	A19,B20,B42,B53,B61,C48,C54
`Chr3:4886252`	`ACC`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	7	A19,B20,B42,B53,B61,C48,C54
`Chr3:4886262`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B30
`Chr3:4886299`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A5,B125,D11
`Chr3:4886310`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B90
`Chr3:4886310`	`GA`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B90

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057801858.1

345 aa

172

345

Sulfotransfer_1

Sulfotransfer_3

PF00685 Sulfotransfer_1 83-342 aa PF13469 Sulfotransfer_3 175-267 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057801858.1`	Pfam	`PF00685`	Sulfotransfer_1	Domain	83	342	6.2e-74	249.4	Sulfotransferase domain
`XP_057801858.1`	Pfam	`PF13469`	Sulfotransfer_3	Domain	175	267	1.5e-10	42.4	Sulfotransferase family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057945875.1
CCCCCTCTGCCTCACCTTCCGCCTCCGAAAGACCGGCGAGCGCCGCCGCCTTACTCCACCTCTCATTCTCTTCCTCGCTTAAGATATAGGGCTTCGATTTCGAATTTGGGGCAGTTTTTGCAGATCTAAGATCTAGGGCTTCGATTTCAACTCCTCTGCAAACCCTAACCAAGCGCAGCCCCCTGCTTCAGCTCCTCTACGTGGCGGTAGCATTCTCGCACGCCACCCCTCCGCTGCCATGATGTATTTGAGCGGTGGAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131017139
ATGCATGCAAACCTAAACACAAAACAATCACCACCCAAAAATTCTAAGAGATACATAAGCATGTCATTTACAAATACCTTCCAACCGCCACCACTATCCCAAGACTTCAAAGACTTCCTCTCCACTCTACCAAGAAAAAAAATATTCGCAAAAGAGCCTCTCTACTGCTATCATTATCAAGGTTTCTGGTACTTGGAGGGCGTCCTCGAAGCTGTGATTTCATGCCAAGAACATTTCCAAGCCGAGGATTCCGACGTCTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057801858.1
MHANLNTKQSPPKNSKRYISMSFTNTFQPPPLSQDFKDFLSTLPRKKIFAKEPLYCYHYQGFWYLEGVLEAVISCQEHFQAEDSDVFVASTPKCGTTWLKAIAFALLNRRRHPAASGDHPLLSSNPHDLVPFLEIGLYGSSKALDIASFPSPRLLSTHMPHSSLPESIRSGSKCKILYVARDPKDTFVSAWHFFTRVGVADFTMAEALEQFCEGLNSYGPFWDHFLGYWKQSLENPERVLFLKYEDMKARPAAEVHRVAE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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