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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G000475`

染色体: Chr03 坐标: 5046979-5050118 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G000475`
名称	SmilChr03G000475
描述	disease resistance protein RPP13-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	5046979 - 5050118 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131017146`
GeneID	`131017146`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131017146`
原始查询	`SmilChr03G000475`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	disease resistance protein RPP13-like
产物	disease resistance protein RPP13-like
Arabidopsis	`AT3G46530` (RPP13) NB-ARC domain-containing disease resistance protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:823806] identity=26.9; qcov=1.04; evalue=1.23e-29; confidence=low
Rice	`Os08g0539700` (Pib-H8) - identity=27.5; qcov=1.1; evalue=1.16e-24; confidence=low
GO	GO:0043531 (ADP binding); GO:0098542 (defense response to other organism)
KEGG	-
Pfam	PF00931 (NB-ARC)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131017146

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	0.60000	`XP_057801869.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057801869.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057801869.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057801869.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057801869.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:5048042`	`T`	`TAC`	2bp_insertion	frameshift_variant	100	A11,A14,A15,A16,A18,A2,A20,A22,A23,A3,A5,A7,A9,B1,B10,B102,B103,B104,B108,B110,B113,B118,B12,B120,B132,B135,B138,B139,B14,B15,B21,B22,B27,B28,B33,B36,B37,B4,B43,B44,B45,B46,B47,B5,B53,B6,B60,B65,B67,B68,B75,B76,B79,B82,B83,B84,B94,B95,C10,C14,C17,C19,C20,C25,C27,C32,C33,C34,C36,C37,C39,C45,C48,C49,C51,C52,C53,C54,C56,C58,C60,C61,C62,C66,C67,C71,C72,C73,C74,C76,C77,C79,C80,C81,C86,C9,D1,D10,D2,D3
`Chr3:5048060`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	16	A20,A21,A25,B115,B121,B22,B23,B41,B50,B53,B60,B75,B99,C29,C78,C85
`Chr3:5048061`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	180	A11,A13,A14,A15,A16,A18,A2,A22,A23,A3,A5,A7,A9,B1,B10,B101,B102,B103,B104,B108,B109,B11,B110,B111,B112,B113,B117,B118,B119,B12,B120,B122,B125,B128,B129,B13,B130,B131,B132,B135,B136,B138,B139,B14,B15,B17,B18,B19,B2,B20,B21,B26,B27,B28,B29,B30,B31,B32,B33,B36,B37,B38,B4,B40,B43,B44,B45,B46,B47,B49,B5,B50,B52,B53,B55,B6,B60,B61,B62,B65,B66,B67,B68,B71,B72,B73,B74,B76,B77,B78,B79,B8,B81,B82,B83,B84,B87,B89,B9,B90,B91,B93,B94,B95,B96,B97,B98,C1,C10,C11,C14,C16,C17,C19,C20,C21,C23,C25,C27,C28,C3,C30,C31,C32,C33,C34,C35,C36,C37,C38,C39,C4,C40,C44,C45,C48,C49,C5,C51,C52,C53,C54,C56,C58,C59,C6,C60,C61,C62,C63,C65,C66,C67,C68,C69,C7,C71,C72,C73,C74,C75,C76,C77,C79,C80,C81,C82,C83,C84,C86,C87,C9,D1,D10,D11,D2,D3,D5,D6,D7
`Chr3:5048063`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	196	A1,A10,A11,A13,A14,A16,A18,A19,A2,A22,A23,A3,A4,A5,A7,A8,A9,B1,B10,B100,B101,B103,B104,B106,B107,B108,B11,B110,B111,B112,B113,B114,B117,B118,B119,B120,B122,B123,B124,B125,B126,B127,B128,B130,B131,B132,B134,B135,B137,B140,B15,B16,B18,B19,B2,B20,B22,B23,B24,B25,B27,B29,B30,B31,B32,B33,B34,B35,B37,B38,B39,B40,B44,B45,B46,B48,B49,B5,B50,B51,B53,B54,B55,B57,B58,B59,B6,B60,B62,B63,B64,B65,B67,B68,B69,B7,B70,B71,B73,B74,B76,B77,B79,B8,B80,B81,B82,B83,B84,B85,B86,B87,B88,B89,B9,B90,B91,B92,B94,B95,B97,B98,B99,C1,C10,C11,C14,C15,C16,C17,C18,C19,C2,C20,C21,C22,C24,C25,C26,C3,C30,C31,C32,C33,C34,C35,C36,C37,C39,C4,C40,C41,C42,C43,C44,C45,C46,C47,C48,C49,C5,C50,C51,C52,C54,C55,C57,C58,C59,C6,C60,C61,C63,C64,C66,C67,C68,C69,C71,C72,C76,C77,C79,C8,C81,C83,C84,C87,C9,D1,D11,D4,D5,D6,D8,D9
`Chr3:5048073`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B30
`Chr3:5048150`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B50
`Chr3:5048177`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A5,B93,C13,C53,D10
`Chr3:5048214`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B93,C53,D10
`Chr3:5048225`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C16
`Chr3:5048232`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	6	B104,C32,C55,C68,C70,D8
`Chr3:5048295`	`T`	`TGA`	2bp_insertion	frameshift_variant	5	B110,B23,C28,C31,D2
`Chr3:5048295`	`T`	`TGA`	2bp_insertion	CDS_variant	5	B110,B23,C28,C31,D2

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057801869.1

376 aa

188

376

NB-ARC

PF00931 NB-ARC 1-147 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057801869.1`	Pfam	`PF00931`	NB-ARC	Domain	1	147	7.5e-18	65.4	NB-ARC domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057945886.1
TGGCCTATTTTTGCAAGTTCGAAAAATGTTGGCCTATTTTTAATTTGCAAGTTTGAAAAATATTGGCTTATTTTTGCATATCTCCCTAAGATAGTGGACTTAAATAATTTTGAACTCCAGGTATTGGCATTTGGCTTCCTTAATCACAGGCATGACTGGTATTGGGAAGACAACTCTTGTAAGAAAAGTGTACAACCATCCAGACGTGGTTAAGAAATTCCGCCGCCGCCGTGTTTGGGTATGTGTTTCTACCAACTTTA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131017146
ATGACTGGTATTGGGAAGACAACTCTTGTAAGAAAAGTGTACAACCATCCAGACGTGGTTAAGAAATTCCGCCGCCGCCGTGTTTGGGTATGTGTTTCTACCAACTTTAGTCATAAAGAAATATTGAAGAAGATAATAGAGCAGGTGGTAGATTGTATGAAATTGAGAAGGGATTCTATATTGGAGAAAATGGAGCGACCAGACAACTTTTGTGTGGGAGAGATGCTTCGCAAACTTCTCAAGGGAATGGCATATTTGAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057801869.1
MTGIGKTTLVRKVYNHPDVVKKFRRRRVWVCVSTNFSHKEILKKIIEQVVDCMKLRRDSILEKMERPDNFCVGEMLRKLLKGMAYLIVLDGFPKEMCLGYIMEFIPLNGKGTRLLLTCRTAYKDLNIGYTHRMETLDPPKSWQLLLKTIPRELKFPKHLENMGREMLRKCDGLPLAIIEMAKQLAKRKPSTESEWEEALKSIDLCSILPLFESSYRKMDAESKPCFLHLAFFKELTSIRTQKLEHVSAIVRMVSESQIRS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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