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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G000481`

染色体: Chr03 坐标: 5118033-5122480 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G000481`
名称	SmilChr03G000481
描述	putative disease resistance RPP13-like protein 3
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	5118033 - 5122480 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131018180`
GeneID	`131018180`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131018180`
原始查询	`SmilChr03G000481`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative disease resistance RPP13-like protein 3
产物	putative disease resistance RPP13-like protein 3
Arabidopsis	`AT1G59218` (AT1G59218) Disease resistance protein (CC-NBS-LRR class) family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842234] identity=29.4; qcov=0.646; evalue=3.44e-50; confidence=low
Rice	`Os01g0547000` - identity=25.8; qcov=0.672; evalue=8.93e-45; confidence=low
GO	GO:0043531 (ADP binding); GO:0098542 (defense response to other organism)
KEGG	-
Pfam	PF00931 (NB-ARC); PF13401 (AAA_22); PF23598 (LRR_14)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131018180

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057802883.1`
2	Cell membrane	细胞膜	0.60000	`XP_057802883.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057802883.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057802883.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057802883.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:5118171`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B36
`Chr3:5118208`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B65,C57
`Chr3:5118213`	`GGT`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	55	A21,A22,A23,A7,B101,B104,B106,B108,B109,B110,B117,B126,B127,B130,B132,B140,B16,B22,B28,B41,B42,B45,B48,B50,B61,B62,B71,B76,B79,B83,B87,B89,C11,C14,C19,C21,C24,C28,C44,C53,C57,C58,C60,C61,C63,C67,C69,C72,C74,C79,C83,D1,D3,D8,D9
`Chr3:5118217`	`T`	`TGA`	2bp_insertion	frameshift_variant	55	A21,A22,A23,A7,B101,B104,B106,B108,B109,B110,B117,B126,B127,B130,B132,B140,B16,B22,B28,B41,B42,B45,B48,B50,B61,B62,B71,B76,B79,B83,B87,B89,C11,C14,C19,C21,C24,C28,C44,C53,C57,C58,C60,C61,C63,C67,C69,C72,C74,C79,C83,D1,D3,D8,D9
`Chr3:5118230`	`ATC`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B128
`Chr3:5118230`	`ATC`	`A`	2bp_deletion	CDS_variant	1	B128
`Chr3:5118261`	`CTT`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	56	A21,A22,A23,A7,B101,B104,B106,B108,B109,B110,B117,B126,B127,B130,B132,B140,B16,B22,B28,B3,B41,B42,B45,B48,B50,B61,B62,B71,B76,B79,B83,B87,B89,C11,C14,C19,C21,C24,C28,C44,C53,C57,C58,C60,C61,C63,C67,C69,C72,C74,C79,C83,D1,D3,D8,D9
`Chr3:5118267`	`C`	`CAT`	2bp_insertion	frameshift_variant	56	A21,A22,A23,A7,B101,B104,B106,B108,B109,B110,B117,B126,B127,B130,B132,B140,B16,B22,B28,B3,B41,B42,B45,B48,B50,B61,B62,B71,B76,B79,B83,B87,B89,C11,C14,C19,C21,C24,C28,C44,C53,C57,C58,C60,C61,C63,C67,C69,C72,C74,C79,C83,D1,D3,D8,D9
`Chr3:5118319`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B118,D7
`Chr3:5118384`	`TAA`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	12	A23,B1,B102,B120,B126,B127,B53,C14,C62,C63,C79,C87
`Chr3:5118404`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C69
`Chr3:5118497`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B111

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057802883.1

1129 aa

564

1129

NB-ARC

AAA_22

NB-ARC

LRR_14

PF00931 NB-ARC 81-247 aa PF13401 AAA_22 85-184 aa PF00931 NB-ARC 421-590 aa PF23598 LRR_14 798-1036 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057802883.1`	Pfam	`PF00931`	NB-ARC	Domain	81	247	7.5e-54	182.6	NB-ARC domain
`XP_057802883.1`	Pfam	`PF13401`	AAA_22	Domain	85	184	2.4e-12	48.0	AAA domain
`XP_057802883.1`	Pfam	`PF00931`	NB-ARC	Domain	421	590	7.5e-54	182.6	NB-ARC domain
`XP_057802883.1`	Pfam	`PF23598`	LRR_14	Repeat	798	1036	1.8e-27	96.7	Leucine-rich repeat region

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057946900.1
ATGCCTGAATTCGGAGTTGATGATGGGGCGGAGACAACATCAGAAAATGTTGGAGAAGAAGAAGACGAAGTTGATGGGGTGGAGACGTCATCAGAAAATGCTGGTGACGAGGAAGAAGACTATGAAGAATTGGGAGTTGATGGGGCGGAGACGACCTCAGAAGTTGTTGGAGAAGAAGGAGATGACGAAGATAAATATATGGAAGAGCTTAAGGGGGATTTTTGTAGTACGTTTTGGGAAGATATGTTGACTGTCTTAAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131018180
ATGCCTGAATTCGGAGTTGATGATGGGGCGGAGACAACATCAGAAAATGTTGGAGAAGAAGAAGACGAAGTTGATGGGGTGGAGACGTCATCAGAAAATGCTGGTGACGAGGAAGAAGACTATGAAGAATTGGGAGTTGATGGGGCGGAGACGACCTCAGAAGTTGTTGGAGAAGAAGGAGATGACGAAGATAAATATATGGAAGAGCTTAAGGGGGATTTTTGTAGTACGTTTTGGGAAGATATGTTGACTGTCTTAAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057802883.1
MPEFGVDDGAETTSENVGEEEDEVDGVETSSENAGDEEEDYEELGVDGAETTSEVVGEEGDDEDKYMEELKGDFCSTFWEDMLTVLITGMAGIGKTTLARQVYNHAHVVARFKYRAWVCVTDLTGKEVLIKLIRQVVYSKKLEGDSLLEKMERRDKKSLQEMLHQHLKGKRYFIVLDDVHKEMNWESIWKGLPHEKKSSKLLLTSRSKNTRRDPFSSDEMESRIHYAYRMQPLNPEESWRFFSKTIFCGIDKSHQFPKHL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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