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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G000488`

染色体: Chr03 坐标: 5220241-5222556 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G000488`
名称	SmilChr03G000488
描述	transcription factor MYB30-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	5220241 - 5222556 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131017164`
GeneID	`131017164`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131017164`
原始查询	`SmilChr03G000488`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	transcription factor MYB30-like
产物	transcription factor MYB30-like
Arabidopsis	`AT1G79180` (MYB63) myb domain protein 63 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:844259] identity=54.9; qcov=0.676; evalue=7.87e-49; confidence=medium
Rice	`Os10g0478300` (MYB110) - identity=58.3; qcov=0.571; evalue=8.59e-49; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF00249 (Myb_DNA-binding); PF13921 (Myb_DNA-bind_6)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131017164

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057801878.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057801878.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057801878.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057801878.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057801878.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:5220295`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A9,B132,B69,C7
`Chr3:5220554`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B104,B107,B65
`Chr3:5222530`	`G`	`GT`	1bp_insertion	frameshift_variant	44	A1,A11,A5,A8,B1,B101,B111,B12,B123,B126,B128,B138,B18,B2,B35,B36,B54,B55,B57,B59,B65,B85,B88,B89,C16,C17,C19,C20,C26,C3,C30,C34,C35,C37,C38,C5,C50,C6,C7,C70,C71,C75,C8,D4
`Chr3:5222548`	`C`	`CAT`	2bp_insertion	frameshift_variant	10	B110,B119,B125,B130,B38,B51,B69,B83,C22,C76

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057801878.1

210 aa

105

210

Myb_DNA-binding

Myb_DNA-bind_6

Myb_DNA-binding

Myb_DNA-bind_6

PF00249 Myb_DNA-binding 14-61 aa PF13921 Myb_DNA-bind_6 17-76 aa PF00249 Myb_DNA-binding 67-109 aa PF13921 Myb_DNA-bind_6 70-129 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057801878.1`	Pfam	`PF00249`	Myb_DNA-binding	Domain	14	61	9.2e-34	116.0	Myb-like DNA-binding domain
`XP_057801878.1`	Pfam	`PF13921`	Myb_DNA-bind_6	Domain	17	76	8.6e-23	81.0	Myb-like DNA-binding domain
`XP_057801878.1`	Pfam	`PF00249`	Myb_DNA-binding	Domain	67	109	9.2e-34	116.0	Myb-like DNA-binding domain
`XP_057801878.1`	Pfam	`PF13921`	Myb_DNA-bind_6	Domain	70	129	8.6e-23	81.0	Myb-like DNA-binding domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057945895.1
ATGGTGAAACGTACTTACGTTGACAAAAATGGAACGAGAAAAGGTGCGTGGACAGAAGAAGAAGACCATAAGTTGAGAGCTTATGTTGAGCGTTTCGGCCATTCGAACTGGAGATTGCTTCCCAACTCTGCAGGTCTAAATAGATGTGGAAAGAGTTGCAGATTGCGATGGATGAACCACTTGAAACCTGGCCTAAAACGAGGTGGTTTCACCCAAGAAGAAAAAGATCTTATCGAAAAACTTCATCATCAACATGGAAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131017164
ATGGTGAAACGTACTTACGTTGACAAAAATGGAACGAGAAAAGGTGCGTGGACAGAAGAAGAAGACCATAAGTTGAGAGCTTATGTTGAGCGTTTCGGCCATTCGAACTGGAGATTGCTTCCCAACTCTGCAGGTCTAAATAGATGTGGAAAGAGTTGCAGATTGCGATGGATGAACCACTTGAAACCTGGCCTAAAACGAGGTGGTTTCACCCAAGAAGAAAAAGATCTTATCGAAAAACTTCATCATCAACATGGAAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057801878.1
MVKRTYVDKNGTRKGAWTEEEDHKLRAYVERFGHSNWRLLPNSAGLNRCGKSCRLRWMNHLKPGLKRGGFTQEEKDLIEKLHHQHGNKWSAIAAELPGRTDHEIKNYWHAHHKNYRDQSKPSKSSDQELSSCSSVVTSSVAPKLSHISPLQLFILESNDSSTQQNCSNVSAITTQNSDGFHDTFWTQPFMVETDSDYDYDFRVFSPLFHT

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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