当前解析结果
SmilChr03G000490| 统一新 Gene ID | SmilChr03G000490 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr03G000490 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr03G000490 |
| 染色体 / SeqID | Chr03 / NC_080389.1 |
| 坐标与链方向 | 5256145 - 5257550 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131018182 |
|---|---|
| GeneID | 131018182 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131018182 |
| 原始查询 | SmilChr03G000490 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131018182 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057802886.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.40000 | XP_057802886.1 |
| 3 | Nucleoplasm | 核质 | 0.20000 | XP_057802886.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057802886.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057802886.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr3:5256191 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | C3,C54,D5 |
Chr3:5256300 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C74 |
Chr3:5256318 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C32 |
Chr3:5256319 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B118,B24,C60 |
Chr3:5256351 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A13,B38,B51,C72 |
Chr3:5256402 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B4,C36,D6 |
Chr3:5256418 |
AAT |
A |
2bp_deletion | frameshift_variant | 8 | B113,B131,B22,B93,C15,C17,C32,C62 |
Chr3:5256419 |
ATG |
A |
2bp_deletion | frameshift_variant | 15 | B109,B49,B63,B67,B69,B73,B81,B92,B96,C11,C27,C45,C60,C82,C9 |
Chr3:5257005 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D11 |
Chr3:5257013 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C48 |
Chr3:5257023 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B49 |
Chr3:5257024 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C38 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。