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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G000492`

染色体: Chr03 坐标: 5270820-5272288 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G000492`
名称	SmilChr03G000492
描述	uncharacterized SmilChr03G000492
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	5270820 - 5272288 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131017168`
GeneID	`131017168`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131017168`
原始查询	`SmilChr03G000492`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os06g0597250; species=rice; confidence=high
产物	hit=Os06g0597250; species=rice; confidence=high
Arabidopsis	`AT2G13770` (AT2G13770) nuclease [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:815861] identity=51.6; qcov=0.286; evalue=3e-35; confidence=weak
Rice	`Os06g0597250` - identity=49.8; qcov=0.975; evalue=3.33e-146; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF04827 (Plant_tran); PF13359 (DDE_Tnp_4); PF28509 (DUF8418)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131017168

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057801881.1`
2	Chromosome	染色体	0.40000	`XP_057801881.1`
3	Telomere	端粒	0.20000	`XP_057801881.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057801881.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057801881.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:5270907`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr3:5270920`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C31
`Chr3:5270977`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B45,C86
`Chr3:5270988`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B137,B96,C32,C68
`Chr3:5271061`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B42
`Chr3:5271063`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B42
`Chr3:5271085`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr3:5271087`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr3:5271107`	`GTA`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	C31
`Chr3:5271107`	`GTA`	`G`	2bp_deletion	CDS_variant	1	C31
`Chr3:5271117`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr3:5271161`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A6,C3

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057801881.1

433 aa

216

433

DUF8418

Plant_tran

DDE_Tnp_4

PF28509 DUF8418 57-96 aa PF04827 Plant_tran 165-367 aa PF13359 DDE_Tnp_4 194-357 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057801881.1`	Pfam	`PF28509`	DUF8418	Domain	57	96	1.6e-22	79.7	Domain of unknown function (DUF8418)
`XP_057801881.1`	Pfam	`PF04827`	Plant_tran	Family	165	367	2e-105	351.6	Plant transposon protein
`XP_057801881.1`	Pfam	`PF13359`	DDE_Tnp_4	Domain	194	357	7.6e-08	32.8	DDE superfamily endonuclease

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057945898.1
CTTACAGTAAATTTTATCACTGCATTTATTTTTCTATATAACATACCTCATATCCAGTACCTAACTCATTCTAAAGCCAAAATGTCTTCTTCATCTTCATCTTCAGATGAATGGGAAGAACGACGTTATCAACAAAATCGTCAAATTGATCGCATTATTGACGATATGCTCATAAACAATCCCAATCTTATTTTAGGAACTTCTTCTTCCACCACTAAAAAAAGGTATTGTGATAGGGAACGTGAAGTTGGTGAGCAACG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131017168
ATGTCTTCTTCATCTTCATCTTCAGATGAATGGGAAGAACGACGTTATCAACAAAATCGTCAAATTGATCGCATTATTGACGATATGCTCATAAACAATCCCAATCTTATTTTAGGAACTTCTTCTTCCACCACTAAAAAAAGGTATTGTGATAGGGAACGTGAAGTTGGTGAGCAACGTTTGATGAGTGATTATTTTGTCCCTAATCCAACGTATACTCCGGAGCTCTTCCGGCGTAGATTTCGCATGCAAAAATCATT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057801881.1
MSSSSSSSDEWEERRYQQNRQIDRIIDDMLINNPNLILGTSSSTTKKRYCDREREVGEQRLMSDYFVPNPTYTPELFRRRFRMQKSLFLRIVDAVTANDEYFQQRPDCTGRQGLSPLQKCTGAMRVLAYGTATDVVDEYLRMSSTVTRDAVIHFVEGIISCFGDTYLRRPNQQDLQRLLYVGEQRGFPRMIGSIDCMHWEWKNCPTAWAGQYAGRSGKPTIILEAVASYDLWIWHAFFGTPGSCNDINVLHRSPVFSDIL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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