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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G000493`

染色体: Chr03 坐标: 5272609-5273628 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G000493`
名称	SmilChr03G000493
描述	uncharacterized SmilChr03G000493
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	5272609 - 5273628 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131018183`
GeneID	`131018183`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131018183`
原始查询	`SmilChr03G000493`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os12g0169300; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os12g0169300; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT3G47680` (AT3G47680) DNA binding protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:823922] identity=31.8; qcov=0.316; evalue=3.37e-11; confidence=low
Rice	`Os12g0169300` - identity=25.4; qcov=0.791; evalue=9.53e-14; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131018183

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057802887.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057802887.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057802887.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057802887.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057802887.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:5272615`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C12,C47
`Chr3:5272633`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	4	A24,B136,C26,C47
`Chr3:5272633`	`GA`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	4	A24,B136,C26,C47
`Chr3:5272662`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B108,C35,C65,C72
`Chr3:5272664`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B129
`Chr3:5272707`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	C26,C34,C73,C87
`Chr3:5272723`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B35,B94,C16,D6,D7
`Chr3:5272781`	`T`	`TTA`	2bp_insertion	frameshift_variant	48	A1,A11,A15,A2,A3,B100,B106,B111,B112,B115,B122,B129,B131,B136,B140,B18,B19,B2,B35,B47,B49,B55,B56,B59,B63,B77,B80,B83,B86,B89,B96,C1,C23,C27,C35,C4,C41,C48,C59,C61,C65,C71,C75,C76,C83,C86,D5,D8
`Chr3:5272784`	`CTA`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	48	A1,A11,A15,A2,A3,B100,B106,B111,B112,B115,B122,B129,B131,B136,B140,B18,B19,B2,B35,B47,B49,B55,B56,B59,B63,B77,B80,B83,B86,B89,B96,C1,C23,C27,C35,C4,C41,C48,C59,C61,C65,C71,C75,C76,C83,C86,D5,D8
`Chr3:5272801`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	52	A21,A25,A6,B1,B105,B113,B114,B118,B123,B133,B134,B138,B2,B23,B34,B35,B36,B4,B44,B47,B52,B61,B64,B68,B69,B7,B75,B78,B83,B9,B90,B93,C1,C16,C18,C20,C21,C29,C31,C44,C45,C46,C53,C62,C63,C67,C69,C7,C73,C80,C83,D1
`Chr3:5272805`	`A`	`AT`	1bp_insertion	frameshift_variant	96	A1,A10,A15,A18,A19,A22,A23,A3,A7,A8,B1,B10,B102,B105,B109,B11,B110,B115,B12,B123,B124,B125,B126,B127,B128,B13,B133,B135,B137,B138,B14,B17,B21,B25,B30,B34,B36,B37,B39,B42,B43,B48,B54,B56,B57,B58,B6,B60,B61,B65,B68,B7,B70,B73,B74,B76,B77,B8,B97,B98,C10,C15,C17,C2,C20,C24,C25,C29,C31,C32,C33,C34,C40,C42,C48,C50,C51,C54,C55,C56,C57,C59,C6,C63,C68,C74,C76,C77,C8,C82,C84,C85,C9,D11,D6,D9
`Chr3:5272808`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	6	A18,B128,B136,C19,C5,C50

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057946904.1
ATGGATCCAAACGACCCCAATTATTATTCAAATTTTGGATCTTTTTTTCACCCTCAAAATTTTTCAAATCCAGAAGATGTTCAAAATTCTCAGTATTACGAGAATTCTCAATTTTCTCCACACCTCAACCAAATTTCTACCCCTCACGAACATCCCATTTCACAAAATATCTCTCGGAATTTATTTCAAGATGTCGAACACCCAAAGAAAAATCAGAAAGCTGCAAAAAATGTAGCTTGGTGCGTGAAAGAAGATGTAGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131018183
ATGGATCCAAACGACCCCAATTATTATTCAAATTTTGGATCTTTTTTTCACCCTCAAAATTTTTCAAATCCAGAAGATGTTCAAAATTCTCAGTATTACGAGAATTCTCAATTTTCTCCACACCTCAACCAAATTTCTACCCCTCACGAACATCCCATTTCACAAAATATCTCTCGGAATTTATTTCAAGATGTCGAACACCCAAAGAAAAATCAGAAAGCTGCAAAAAATGTAGCTTGGTGCGTGAAAGAAGATGTAGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057802887.1
MDPNDPNYYSNFGSFFHPQNFSNPEDVQNSQYYENSQFSPHLNQISTPHEHPISQNISRNLFQDVEHPKKNQKAAKNVAWCVKEDVALMSSWICVSEDKQKGKNQRGATMWERVQNMYHEAQKENPDEIGPRNIESMKGRFKRLNENANKWIAACKEANARKRSGMSQKDIEMEAHSIYEAGGSKFQDLVVFNDVMSKHPKWNLAINEVGDDQESGGSTKRSKTSEDGDYFIPSNPETPTTGGSTMSRPTGRDKAKRKGK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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